RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 HOXB7P09629 217 aa30.76■■■□□ 2.51
SERF1A-202ENST00000354833 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
SERF1A-202ENST00000354833 G2E3Q7L622 706 aa30.74■■■□□ 2.51
SERF1A-202ENST00000354833 IFNL2Q8IZJ0 200 aa30.74■■■□□ 2.51
SERF1A-202ENST00000354833 PKD1L3Q7Z443 1732 aa30.74■■■□□ 2.51
SERF1A-202ENST00000354833 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa30.74■■■□□ 2.51
SERF1A-202ENST00000354833 KCNQ3O43525 872 aa30.72■■■□□ 2.51
SERF1A-202ENST00000354833 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
SERF1A-202ENST00000354833 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
SERF1A-202ENST00000354833 RGS3P49796 1198 aa30.72■■■□□ 2.51
SERF1A-202ENST00000354833 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa30.72■■■□□ 2.51
SERF1A-202ENST00000354833 CHMP4AQ9BY43 222 aa30.72■■■□□ 2.51
SERF1A-202ENST00000354833 PDE4AP27815 886 aa30.7■■■□□ 2.51
SERF1A-202ENST00000354833 NECTIN2Q92692 538 aa30.7■■■□□ 2.5
SERF1A-202ENST00000354833 CARD10Q9BWT7 1032 aa30.7■■■□□ 2.5
SERF1A-202ENST00000354833 FLIIQ13045 1269 aa30.69■■■□□ 2.5
SERF1A-202ENST00000354833 CYP27B1O15528 508 aa30.68■■■□□ 2.5
SERF1A-202ENST00000354833 BACH2Q9BYV9 841 aa30.68■■■□□ 2.5
SERF1A-202ENST00000354833 SCN11AQ9UI33 1791 aa30.68■■■□□ 2.5
SERF1A-202ENST00000354833 DCAF5Q96JK2 942 aa30.67■■■□□ 2.5
SERF1A-202ENST00000354833 SLC52A2Q9HAB3 445 aa30.67■■■□□ 2.5
SERF1A-202ENST00000354833 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa30.67■■■□□ 2.5
SERF1A-202ENST00000354833 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
SERF1A-202ENST00000354833 HEG1Q9ULI3 1381 aa30.66■■■□□ 2.5
SERF1A-202ENST00000354833 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
SERF1A-202ENST00000354833 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
SERF1A-202ENST00000354833 CACNA1FO60840 1977 aa30.65■■■□□ 2.5
SERF1A-202ENST00000354833 EVA1CP58658 441 aa30.65■■■□□ 2.5
SERF1A-202ENST00000354833 SMC5Q8IY18 1101 aa30.65■■■□□ 2.5
SERF1A-202ENST00000354833 STRN4Q9NRL3 753 aa30.65■■■□□ 2.5
SERF1A-202ENST00000354833 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
SERF1A-202ENST00000354833 C1orf115Q9H7X2 142 aa30.64■■■□□ 2.5
SERF1A-202ENST00000354833 MRC1P22897 1456 aa30.64■■■□□ 2.49
SERF1A-202ENST00000354833 CCT4P50991 539 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
SERF1A-202ENST00000354833 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
SERF1A-202ENST00000354833 F6X3S4 739 aa30.63■■■□□ 2.49
SERF1A-202ENST00000354833 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
SERF1A-202ENST00000354833 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
SERF1A-202ENST00000354833 IL2RBP14784 551 aa30.61■■■□□ 2.49
SERF1A-202ENST00000354833 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
SERF1A-202ENST00000354833 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa30.6■■■□□ 2.49
SERF1A-202ENST00000354833 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa30.6■■■□□ 2.49
SERF1A-202ENST00000354833 SLC4A10Q6U841 1118 aa30.6■■■□□ 2.49
SERF1A-202ENST00000354833 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa30.6■■■□□ 2.49
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF790Q6PG37 636 aa30.59■■■□□ 2.49
SERF1A-202ENST00000354833 BTG4Q9NY30 223 aa30.59■■■□□ 2.49
SERF1A-202ENST00000354833 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
SERF1A-202ENST00000354833 SIRT2Q8IXJ6 389 aa30.58■■■□□ 2.49
SERF1A-202ENST00000354833 CHPF2Q9P2E5 772 aa30.58■■■□□ 2.49
SERF1A-202ENST00000354833 FAM161AQ3B820 660 aa30.57■■■□□ 2.48
SERF1A-202ENST00000354833 PXDNLA1KZ92 1463 aa30.57■■■□□ 2.48
SERF1A-202ENST00000354833 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
SERF1A-202ENST00000354833 MEIS3Q99687 375 aa30.56■■■□□ 2.48
SERF1A-202ENST00000354833 GCC1Q96CN9 775 aa30.55■■■□□ 2.48
SERF1A-202ENST00000354833 TOM1O60784 492 aa30.55■■■□□ 2.48
SERF1A-202ENST00000354833 SLC39A6Q13433 755 aa30.55■■■□□ 2.48
SERF1A-202ENST00000354833 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
SERF1A-202ENST00000354833 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
SERF1A-202ENST00000354833 PHLPP1O60346 1717 aa30.54■■■□□ 2.48
SERF1A-202ENST00000354833 C8orf34Q49A92 452 aa30.53■■■□□ 2.48
SERF1A-202ENST00000354833 ATP10DQ9P241 1426 aa30.53■■■□□ 2.48
SERF1A-202ENST00000354833 CABP4P57796 275 aa30.53■■■□□ 2.48
SERF1A-202ENST00000354833 NUCB1Q02818 461 aa30.53■■■□□ 2.48
SERF1A-202ENST00000354833 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
SERF1A-202ENST00000354833 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
SERF1A-202ENST00000354833 ANKRD44Q8N8A2 993 aa30.52■■■□□ 2.48
SERF1A-202ENST00000354833 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa30.5■■■□□ 2.47
SERF1A-202ENST00000354833 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
SERF1A-202ENST00000354833 CEP85Q6P2H3 762 aa30.49■■■□□ 2.47
SERF1A-202ENST00000354833 TTC5Q8N0Z6 440 aa30.48■■■□□ 2.47
SERF1A-202ENST00000354833 SHANK3Q9BYB0 1731 aa30.48■■■□□ 2.47
SERF1A-202ENST00000354833 ERVV-2B6SEH9 535 aa30.48■■■□□ 2.47
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
SERF1A-202ENST00000354833 USP35Q9P2H5 1018 aa30.47■■■□□ 2.47
SERF1A-202ENST00000354833 ANXA1P04083 346 aa30.46■■■□□ 2.47
SERF1A-202ENST00000354833 CHD1LQ86WJ1 897 aa30.46■■■□□ 2.47
SERF1A-202ENST00000354833 GNAI3P08754 354 aa30.46■■■□□ 2.47
SERF1A-202ENST00000354833 PIP4K2BP78356 416 aa30.46■■■□□ 2.47
SERF1A-202ENST00000354833 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
SERF1A-202ENST00000354833 HYPKQ9NX55 129 aa30.45■■■□□ 2.47
SERF1A-202ENST00000354833 FMNL2Q96PY5 1086 aa30.44■■■□□ 2.46
SERF1A-202ENST00000354833 GNAI2P04899 355 aa30.44■■■□□ 2.46
SERF1A-202ENST00000354833 PROSER3Q2NL68 480 aa30.44■■■□□ 2.46
SERF1A-202ENST00000354833 DCTPP1Q9H773 170 aa30.44■■■□□ 2.46
SERF1A-202ENST00000354833 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP30.44■■■□□ 2.46
SERF1A-202ENST00000354833 C5P01031 1676 aa30.43■■■□□ 2.46
SERF1A-202ENST00000354833 PI4KAP2A4QPH2 592 aa30.43■■■□□ 2.46
SERF1A-202ENST00000354833 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa30.43■■■□□ 2.46
SERF1A-202ENST00000354833 DNAAF4Q8WXU2 420 aa30.43■■■□□ 2.46
SERF1A-202ENST00000354833 ADCY9O60503 1353 aa30.42■■■□□ 2.46
SERF1A-202ENST00000354833 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
SERF1A-202ENST00000354833 ANKRD45Q5TZF3 282 aa30.42■■■□□ 2.46
SERF1A-202ENST00000354833 DISP2A7MBM2 1401 aa30.42■■■□□ 2.46
SERF1A-202ENST00000354833 LNPKQ9C0E8 428 aa30.42■■■□□ 2.46
SERF1A-202ENST00000354833 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa30.42■■■□□ 2.46
SERF1A-202ENST00000354833 PDIA6Q15084 440 aa30.41■■■□□ 2.46
SERF1A-202ENST00000354833 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
SERF1A-202ENST00000354833 USP44Q9H0E7 712 aa30.4■■■□□ 2.46
SERF1A-202ENST00000354833 BEND3Q5T5X7 828 aa30.39■■■□□ 2.46
SERF1A-202ENST00000354833 HMMRO75330 724 aa30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.5 ms