RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 CCDC70Q6NSX1 233 aa24.57■■□□□ 1.52
NISCH-201ENST00000345716 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
NISCH-201ENST00000345716 POLKQ9UBT6 870 aa24.57■■□□□ 1.52
NISCH-201ENST00000345716 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
NISCH-201ENST00000345716 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.57■■□□□ 1.52
NISCH-201ENST00000345716 CCDC69A6NI79 296 aa24.56■■□□□ 1.52
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NISCH-201ENST00000345716 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.56■■□□□ 1.52
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NISCH-201ENST00000345716 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.53■■□□□ 1.52
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NISCH-201ENST00000345716 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.51■■□□□ 1.51
NISCH-201ENST00000345716 PBRM1Q86U86 1689 aa24.51■■□□□ 1.51
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NISCH-201ENST00000345716 A0A087WZG4 1122 aa24.51■■□□□ 1.51
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NISCH-201ENST00000345716 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.5■■□□□ 1.51
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NISCH-201ENST00000345716 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.5■■□□□ 1.51
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NISCH-201ENST00000345716 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.48■■□□□ 1.51
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NISCH-201ENST00000345716 ABCC1P33527 1531 aa24.44■■□□□ 1.5
NISCH-201ENST00000345716 CHRNA2Q15822 529 aa24.44■■□□□ 1.5
NISCH-201ENST00000345716 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.43■■□□□ 1.5
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NISCH-201ENST00000345716 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
NISCH-201ENST00000345716 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.43■■□□□ 1.5
NISCH-201ENST00000345716 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
NISCH-201ENST00000345716 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.42■■□□□ 1.5
NISCH-201ENST00000345716 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa24.42■■□□□ 1.5
NISCH-201ENST00000345716 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.42■■□□□ 1.5
NISCH-201ENST00000345716 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.42■■□□□ 1.5
NISCH-201ENST00000345716 ATP2B2Q01814 1243 aa24.42■■□□□ 1.5
NISCH-201ENST00000345716 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
NISCH-201ENST00000345716 VAMP4O75379 141 aa24.41■■□□□ 1.5
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