RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 PIP4K2BP78356 416 aa9.55□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 WASHC4Q2M389 1173 aa9.55□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa9.55□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 NOL3O60936 208 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 TANGO6Q9C0B7 1094 aa9.54□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 OGFRQ9NZT2 677 aa9.54□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 FSD2A1L4K1 749 aa9.54□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 KIF5BP33176 963 aa9.54□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa9.54□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.54□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 PLVAPQ9BX97 442 aa9.54□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa9.54□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 PDRG1Q9NUG6 133 aa9.53□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 TSPYL4Q9UJ04 414 aa9.53□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 RASAL2Q9UJF2 1139 aa9.53□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 FAM184BQ9ULE4 1060 aa9.53□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 URI1O94763 535 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 MROH2BQ7Z745 1585 aa9.53□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 UBE2HP62256 183 aa9.52□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 WDR97A6NE52 1622 aa9.52□□□□□ -0.88
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC69A6NI79 296 aa9.52□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.52□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 IFT74Q96LB3 600 aa9.52□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 TSG101Q99816 390 aa9.52□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 ADCY5O95622 1261 aa9.52□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC113Q9H0I3 377 aa9.52□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 PDS5BQ9NTI5 1447 aa9.52□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 ANAPC15P60006 121 aa9.52□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 SPECC1Q5M775 1068 aa9.52□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 STIM2Q9P246 746 aa9.52□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 FERP16591 822 aa9.52□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC6Q16204 474 aa9.52□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 FBF1Q8TES7 1133 aa9.52□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.52□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 KANK3Q6NY19 840 aa9.51□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 RAI14Q9P0K7 980 aa9.51□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 HFM1A2PYH4 1435 aa9.51□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CAPN2P17655 700 aa9.51□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 PRPHP41219 470 aa9.51□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CTAGE9A4FU28 777 aa9.51□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa9.51□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 GOLGA1Q92805 767 aa9.51□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 KIF4AO95239 1232 aa9.51□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 IKBKGQ9Y6K9 419 aa9.51□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 MAATS1Q7Z4T9 603 aa9.51□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 TACC1O75410 805 aa9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 DAPK1P53355 1430 aa9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 RAD21O60216 631 aa9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 NBPF11Q86T75 865 aa9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC178Q5BJE1 867 aa9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 GOPCQ9HD26 462 aa9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC172P0C7W6 258 aa9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CASTP20810 708 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC110Q8TBZ0 833 aa9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 GAS2L2Q8NHY3 880 aa9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 SMC6Q96SB8 1091 aa9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 ARHGAP25P42331 645 aa9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 FMNL3Q8IVF7 1028 aa9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 OTUD6BQ8N6M0 293 aa9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 RAB34Q9BZG1 259 aa9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC38Q502W7 563 aa9.5□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 NEUROD6Q96NK8 337 aa9.49□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 TUBB2AQ13885 445 aa9.49□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 FERMT1Q9BQL6 677 aa9.49□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 TUBB2BQ9BVA1 445 aa9.49□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 HYPKQ9NX55 129 aa9.49□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 TIAM1Q13009 1591 aa9.49□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.49□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 SURF6O75683 361 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 GGT6Q6P531 493 aa9.49□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa9.49□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC158Q5M9N0 1113 aa9.49□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CEP128Q6ZU80 1094 aa9.49□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 UBE4AQ14139 1066 aa9.49□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 LMNTD2Q8IXW0 634 aa9.49□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 PAF1Q8N7H5 531 aa9.49□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 CETN1Q12798 172 aa9.48□□□□□ -0.89
PKHD1-201ENST00000340994 HDXQ7Z353 690 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.9 ms