RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 GRPEL1Q9HAV7 217 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 MX1P20591 662 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
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PTPRM-201ENST00000332175 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 NEBLO76041 1014 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 F6X3S4 739 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 TXLNBQ8N3L3 684 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC112Q8NEF3 446 aa26.21■■□□□ 1.79
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PTPRM-201ENST00000332175 CCDC82Q8N4S0 544 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 PLCD4Q9BRC7 762 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
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PTPRM-201ENST00000332175 GUCY1B3Q02153 619 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 SCLT1Q96NL6 688 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 NAPBQ9H115 298 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
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PTPRM-201ENST00000332175 UBA5Q9GZZ9 404 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
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PTPRM-201ENST00000332175 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.16■■□□□ 1.78
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PTPRM-201ENST00000332175 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 SYCE3A1L190 88 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRM-201ENST00000332175 GPTP24298 496 aa26.15■■□□□ 1.78
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PTPRM-201ENST00000332175 ARHGEF11O15085 1522 aa26.14■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 WDR97A6NE52 1622 aa26.14■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 FOXO3O43524 673 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 MAP3K11Q16584 847 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.13■■□□□ 1.77
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PTPRM-201ENST00000332175 CALRP27797 417 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 ERLIN1O75477 346 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 MAP3K12Q12852 859 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 TOPBP1Q92547 1522 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 TAF3Q5VWG9 929 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.1■■□□□ 1.77
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC12A7Q9Y666 1083 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 UQCRHLA0A096LP55 91 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 UQCRHP07919 91 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.09■■□□□ 1.77
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF213O14771 459 aa26.08■■□□□ 1.77
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PTPRM-201ENST00000332175 IL27Q8NEV9 243 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRM-201ENST00000332175 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.08■■□□□ 1.77
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PTPRM-201ENST00000332175 C8orf76Q96K31 380 aa26.08■■□□□ 1.76
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PTPRM-201ENST00000332175 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC66A2RUB6 948 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 A0A087WZG4 1122 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
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