RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEPT12Q8IYM1 358 aa35.46■■■■□ 3.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 RCAN3Q9UKA8 241 aa35.46■■■■□ 3.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa35.45■■■■□ 3.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRC1P22897 1456 aa35.43■■■■□ 3.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMOD3Q9NYL9 352 aa35.42■■■■□ 3.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 RXRBP28702 533 aa35.39■■■■□ 3.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTC5Q8N0Z6 440 aa35.37■■■■□ 3.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 C8orf58Q8NAV2 365 aa35.37■■■■□ 3.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF790Q6PG37 636 aa35.35■■■■□ 3.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC39A6Q13433 755 aa35.33■■■■□ 3.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSPYL6Q8N831 410 aa35.33■■■■□ 3.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF428Q96B54 188 aa35.33■■■■□ 3.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNQ3O43525 872 aa35.32■■■■□ 3.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa35.32■■■■□ 3.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT24Q2M2I5 525 aa35.32■■■■□ 3.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 KDM3BQ7LBC6 1761 aa35.31■■■■□ 3.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 VAMP4O75379 141 aa35.31■■■■□ 3.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACSBG1Q96GR2 724 aa35.31■■■■□ 3.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIGBQ92521 554 aa35.3■■■■□ 3.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 RARSP54136 660 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT27Q7Z3Y8 459 aa35.28■■■■□ 3.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 POTEAQ6S8J7 498 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 FMNL2Q96PY5 1086 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHMP4AQ9BY43 222 aa35.27■■■■□ 3.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 BCL9O00512 1426 aa35.26■■■■□ 3.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 DOT1LQ8TEK3 1739 aa35.26■■■■□ 3.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALDH1L2Q3SY69 923 aa35.25■■■■□ 3.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOXB7P09629 217 aa35.24■■■■□ 3.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMC4Q9NTJ3 1288 aa35.24■■■■□ 3.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM182BQ5T319 152 aa35.23■■■■□ 3.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 KAT6BQ8WYB5 2073 aa35.23■■■■□ 3.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITGB4P16144 1822 aa35.22■■■■□ 3.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 BCAR3O75815 825 aa35.22■■■■□ 3.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 SSH1Q8WYL5 1049 aa35.21■■■■□ 3.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 BCL2L13Q9BXK5 485 aa35.21■■■■□ 3.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASAP1Q9ULH1 1129 aa35.21■■■■□ 3.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATG3Q9NT62 314 aa35.2■■■■□ 3.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM196AQ6ZSG2 479 aa35.19■■■■□ 3.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEFLP07196 543 aa35.18■■■■□ 3.22
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC30Q5VVM6 783 aa35.18■■■■□ 3.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 HEG1Q9ULI3 1381 aa35.17■■■■□ 3.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNQ2O43526 872 aa35.17■■■■□ 3.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RRP1P56182 461 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa35.17■■■■□ 3.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 STK31Q9BXU1 1019 aa35.16■■■■□ 3.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 PAPPAQ13219 1627 aa35.15■■■■□ 3.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGS12O14924 1447 aa35.14■■■■□ 3.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF123Q5XPI4 1314 aa35.14■■■■□ 3.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 NECTIN2Q92692 538 aa35.13■■■■□ 3.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KIF16BQ96L93 1317 aa35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PLIN1O60240 522 aa35.09■■■■□ 3.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 VSIG10Q8N0Z9 540 aa35.09■■■■□ 3.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBR2Q8IWV8 1755 aa35.08■■■■□ 3.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa35.08■■■■□ 3.21
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC4A2P04920 1241 aa35.08■■■■□ 3.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 NHSQ6T4R5 1651 aa35.07■■■■□ 3.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa35.05■■■■□ 3.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 USP16Q9Y5T5 823 aa35.04■■■■□ 3.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHPF2Q9P2E5 772 aa35.02■■■■□ 3.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTF1AQ7RTS3 328 aa35.01■■■■□ 3.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 MS4A1P11836 297 aa35.01■■■■□ 3.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa35■■■■□ 3.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM37O94972 964 aa35■■■■□ 3.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 STARD3NLO95772 234 aa35■■■■□ 3.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIK1P57059 783 aa35■■■■□ 3.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 C5P01031 1676 aa34.99■■■■□ 3.19
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