RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIAA2012Q0VF49 1180 aa27.09■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP7BP35670 1465 aa27.09■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP48Q86UV5 1035 aa27.08■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 RILPL2Q969X0 211 aa27.08■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 HMMRO75330 724 aa27.08■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.08■■□□□ 1.93
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTPRCP08575 1304 aa27.07■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa27.06■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 MCM2P49736 904 aa27.06■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRDM10Q9NQV6 1147 aa27.05■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP25Q9UHP3 1055 aa27.05■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.04■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 TCHHQ07283 1943 aa27.04■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHMLP26374 656 aa27.03■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.03■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 IL25Q9H293 177 aa27.03■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 CPS1P31327 1500 aa27.02■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 MCCP23508 829 aa27.02■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 SALL3Q9BXA9 1300 aa27.02■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 MX1P20591 662 aa27.02■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
GRAMD1A-201ENST00000317991 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM177BA6PVY3 158 aa27■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYRIPQ8NFW9 859 aa27■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRCC1Q9C099 1032 aa27■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIAA0232Q92628 1395 aa27■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.98■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 FOXO3O43524 673 aa26.98■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADCY5O95622 1261 aa26.98■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 GNAI2P04899 355 aa26.98■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 CNPY2Q9Y2B0 182 aa26.98■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.98■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANAPC15P60006 121 aa26.97■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 DTNBO60941 627 aa26.97■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 PHF14O94880 888 aa26.97■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 PIBF1Q8WXW3 757 aa26.97■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF710Q8N1W2 664 aa26.96■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.95■■□□□ 1.91
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 MLECQ14165 292 aa26.94■■□□□ 1.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.94■■□□□ 1.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 SOX12O15370 315 aa26.93■■□□□ 1.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.93■■□□□ 1.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLCB2Q00722 1185 aa26.93■■□□□ 1.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 NECTIN2Q92692 538 aa26.93■■□□□ 1.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.92■■□□□ 1.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.92■■□□□ 1.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC183Q5T5S1 534 aa26.92■■□□□ 1.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM184AQ8NB25 1140 aa26.92■■□□□ 1.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 CRB1P82279 1406 aa26.91■■□□□ 1.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 UVSSAQ2YD98 709 aa26.91■■□□□ 1.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.91■■□□□ 1.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.89■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP8B2P98198 1209 aa26.88■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRIMPOLQ96LW4 560 aa26.88■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 HSPA4P34932 840 aa26.88■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.88■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 FIBPO43427 364 aa26.87■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 GIMAP6Q6P9H5 292 aa26.87■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 STAP2Q9UGK3 403 aa26.87■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 AP5Z1O43299 807 aa26.86■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM87AQ8NBN3 555 aa26.86■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 DLC1Q96QB1 1528 aa26.85■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 KDM4AO75164 1064 aa26.85■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 SYT1P21579 422 aa26.85■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 CBX1P83916 185 aa26.85■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 CPA1P15085 419 aa26.84■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 RASEFQ8IZ41 740 aa26.84■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 IL17RAQ96F46 866 aa26.84■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 SSH2Q76I76 1423 aa26.84■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUTM2FA1L443 756 aa26.84■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLEKHG5O94827 1062 aa26.84■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 FLIIQ13045 1269 aa26.84■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.84■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 AK2P54819 239 aa26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms