RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 STK38Q15208 465 aa25.25■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 TRIM22Q8IYM9 498 aa25.25■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 PIK3R4Q99570 1358 aa25.25■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 TDO2P48775 406 aa25.24■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 OLFM4Q6UX06 510 aa25.24■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.24■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 CCDC69A6NI79 296 aa25.24■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.24■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 NPATQ14207 1427 aa25.24■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.24■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 ZPR1O75312 459 aa25.23■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 ABCC1P33527 1531 aa25.23■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.23■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 PDE4CQ08493 712 aa25.22■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.22■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 A0A1W2PP64 1363 aa25.22■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 ZNF592Q92610 1267 aa25.21■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 ABCF2Q9UG63 623 aa25.21■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 AIDAQ96BJ3 306 aa25.21■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 TBX22Q9Y458 520 aa25.21■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 ATP10AO60312 1499 aa25.21■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
LRP5-201ENST00000294304 KCNA6P17658 529 aa25.2■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 NUP133Q8WUM0 1156 aa25.2■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.2■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 FLT4P35916 1363 aa25.19■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 ANXA1P04083 346 aa25.19■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 JMYQ8N9B5 988 aa25.19■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.19■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 ATP2B2Q01814 1243 aa25.19■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 KRT85P78386 507 aa25.18■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 PIK3C2GO75747 1445 aa25.18■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 UBAC1Q9BSL1 405 aa25.18■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 IGHDP01880 384 aa25.17■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 GPTP24298 496 aa25.17■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 HOMER1Q86YM7 354 aa25.17■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.16■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.16■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 CDKL5O76039 1030 aa25.16■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.16■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 TSPY26PQ9H489 355 aa25.16■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.16■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.16■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.15■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 TXLNAP40222 546 aa25.15■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.625e-6■■□□□ 12.3
LRP5-201ENST00000294304 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.15■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.15■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa25.15■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.14■■□□□ 1.62
LRP5-201ENST00000294304 ZFYVE9O95405 1425 aa25.13■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 ME1P48163 572 aa25.13■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.13■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.13■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.13■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 TRPM2O94759 1503 aa25.13■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 BMP2KLQ5H9B9 411 aa25.12■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 TRIM5Q9C035 493 aa25.12■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 MEIS3Q99687 375 aa25.11■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.1■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa25.1■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 GCP02774 474 aa25.1■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 HSPA2P54652 639 aa25.1■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 SLC39A6Q13433 755 aa25.1■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 SLC5A1P13866 664 aa25.1■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 EYA1Q99502 592 aa25.09■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 MCM4P33991 863 aa25.09■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.09■■□□□ 1.61
LRP5-201ENST00000294304 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.09■■□□□ 1.61
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