RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 NEFHP12036 1026 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa15.94■□□□□ 0.14
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ERLIN2O94905 339 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 EIF5P55010 431 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMX1Q9H3N1 280 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 KIAA1328Q86T90 577 aa15.93■□□□□ 0.14
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TRAPPC10-201ENST00000291574 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.91■□□□□ 0.14
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TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC26A8Q96RN1 970 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 CCDC82Q8N4S0 544 aa15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 DYNC1I1O14576 645 aa15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
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TRAPPC10-201ENST00000291574 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa15.9■□□□□ 0.14
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TRAPPC10-201ENST00000291574 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.141e-8■■■■■ 86.5
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TRAPPC10-201ENST00000291574 GNAT3A8MTJ3 354 aa15.9■□□□□ 0.14
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TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa15.89■□□□□ 0.13
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ABCC11Q96J66 1382 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa15.88■□□□□ 0.13
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TRAPPC10-201ENST00000291574 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
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TRAPPC10-201ENST00000291574 LRSAM1Q6UWE0 723 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 WAPLQ7Z5K2 1190 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 CCDC148Q8NFR7 591 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 GBP3Q9H0R5 595 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMC6Q7Z403 805 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMX3Q96JJ7 454 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 SOGA3Q5TF21 947 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 NME9Q86XW9 330 aa15.87■□□□□ 0.13
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TRAPPC10-201ENST00000291574 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa15.87■□□□□ 0.13
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TRAPPC10-201ENST00000291574 TTC22Q5TAA0 569 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 GRIN2BQ13224 1484 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 AIDAQ96BJ3 306 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 ANKRD62A6NC57 917 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 DNA2P51530 1060 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 RAI14Q9P0K7 980 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 TXLNBQ8N3L3 684 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 PRIMPOLQ96LW4 560 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 LRP2BPQ9P2M1 347 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 CTAGE5O15320 804 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 WASF1Q92558 559 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 ABCF2Q9UG63 623 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 NCAPD3P42695 1498 aa15.84■□□□□ 0.13
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