RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.76■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.76■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.75■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 RAI14Q9P0K7 980 aa24.75■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.74■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa24.74■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0754O94854 1291 aa24.74■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.74■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.73■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 PTPRCP08575 1304 aa24.73■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM27P14373 513 aa24.73■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF11O15085 1522 aa24.73■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 BMP2KLQ5H9B9 411 aa24.72■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 NSD2O96028 1365 aa24.72■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.72■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 CAMK4Q16566 473 aa24.72■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 STARD3NLO95772 234 aa24.71■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 CTAGE5O15320 804 aa24.71■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 PTPN14Q15678 1187 aa24.71■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN12O43309 604 aa24.71■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.71■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.7■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 METTL24Q5JXM2 366 aa24.7■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.7■■□□□ 1.55
CCSAP-201ENST00000284617 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.7■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.7■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 IQGAP2Q13576 1575 aa24.7■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 SSFA2P28290 1259 aa24.7■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 GBP3Q9H0R5 595 aa24.7■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.69■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 NEFHP12036 1026 aa24.68■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.68■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa24.68■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1328Q86T90 577 aa24.68■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 SKAP1Q86WV1 359 aa24.68■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 C8orf76Q96K31 380 aa24.67■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 NME9Q86XW9 330 aa24.67■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL34Q8N239 644 aa24.67■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 KIF18AQ8NI77 898 aa24.67■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC148Q8NFR7 591 aa24.67■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 TMCO3Q6UWJ1 677 aa24.66■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO3Q9UK99 471 aa24.66■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.66■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 IL16Q14005 1332 aa24.66■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 TAF4BQ92750 862 aa24.66■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.65■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 F6X3S4 739 aa24.65■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 ABCF2Q9UG63 623 aa24.64■■□□□ 1.54
CCSAP-201ENST00000284617 NEMFO60524 1076 aa24.64■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.64■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.64■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC102AQ96A19 550 aa24.64■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 MYD88Q99836 296 aa24.64■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 HYPKQ9NX55 129 aa24.63■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.63■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 NAPBQ9H115 298 aa24.63■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 EVI5LQ96CN4 794 aa24.63■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 FLIIQ13045 1269 aa24.63■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.63■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.62■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 MCM5P33992 734 aa24.62■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 CENPHQ9H3R5 247 aa24.62■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.61■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 TOP1P11387 765 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.6■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 CALRP27797 417 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 USP8P40818 1118 aa24.6■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 MAP3K12Q12852 859 aa24.6■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 KIF5CO60282 957 aa24.6■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 CRACR2AQ9BSW2 395 aa24.6■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 SPA17Q15506 151 aa24.59■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.59■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 USP25Q9UHP3 1055 aa24.59■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 FAM193AP78312 1265 aa24.59■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF213O14771 459 aa24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.5 ms