RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 RPAINQ86UA6 219 aa16.76■□□□□ 0.27
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PTPRO-201ENST00000281171 TCP11L2Q8N4U5 519 aa16.76■□□□□ 0.27
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PTPRO-201ENST00000281171 DACH1Q9UI36 760 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRO-201ENST00000281171 BAG4O95429 457 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
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PTPRO-201ENST00000281171 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-201ENST00000281171 NLRP2Q9NX02 1062 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRO-201ENST00000281171 BRMS1Q9HCU9 246 aa16.75■□□□□ 0.27
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PTPRO-201ENST00000281171 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTPRO-201ENST00000281171 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa16.71■□□□□ 0.27
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PTPRO-201ENST00000281171 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.71■□□□□ 0.26
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PTPRO-201ENST00000281171 POTEDQ86YR6 584 aa16.7■□□□□ 0.26
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PTPRO-201ENST00000281171 PRKAR2BP31323 418 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRO-201ENST00000281171 NBPF8Q3BBV2 869 aa16.69■□□□□ 0.26
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PTPRO-201ENST00000281171 FCHSD2O94868 740 aa16.68■□□□□ 0.26
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PTPRO-201ENST00000281171 SEPT6Q14141 434 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRO-201ENST00000281171 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
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PTPRO-201ENST00000281171 VPS18Q9P253 973 aa16.68■□□□□ 0.26
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PTPRO-201ENST00000281171 CEP112Q8N8E3 955 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRO-201ENST00000281171 JMYQ8N9B5 988 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRO-201ENST00000281171 CEP83Q9Y592 693 aa16.67■□□□□ 0.26
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PTPRO-201ENST00000281171 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
PTPRO-201ENST00000281171 ANKRD1Q15327 319 aa16.66■□□□□ 0.26
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PTPRO-201ENST00000281171 KCNH5Q8NCM2 988 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRO-201ENST00000281171 ERO1AQ96HE7 468 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRO-201ENST00000281171 SCLT1Q96NL6 688 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRO-201ENST00000281171 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
PTPRO-201ENST00000281171 ME1P48163 572 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRO-201ENST00000281171 TUBB4BP68371 445 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRO-201ENST00000281171 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
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