RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 DCAF5Q96JK2 942 aa28.25■■■□□ 2.11
CITED1-201ENST00000246139 KDRP35968 1356 aa28.24■■■□□ 2.11
CITED1-201ENST00000246139 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.23■■■□□ 2.11
CITED1-201ENST00000246139 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.23■■■□□ 2.11
CITED1-201ENST00000246139 SIK1P57059 783 aa28.23■■■□□ 2.11
CITED1-201ENST00000246139 AMIGO3Q86WK7 504 aa28.23■■■□□ 2.11
CITED1-201ENST00000246139 AK7Q96M32 723 aa28.23■■■□□ 2.11
CITED1-201ENST00000246139 CABP4P57796 275 aa28.21■■■□□ 2.11
CITED1-201ENST00000246139 SMIM5Q71RC9 77 aa28.21■■■□□ 2.11
CITED1-201ENST00000246139 ATG3Q9NT62 314 aa28.21■■■□□ 2.11
CITED1-201ENST00000246139 HMOX1P09601 288 aa28.2■■■□□ 2.1
CITED1-201ENST00000246139 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.1
CITED1-201ENST00000246139 FLAD1Q8NFF5 587 aa28.2■■■□□ 2.1
CITED1-201ENST00000246139 C4BP0C0L5 1744 aa28.19■■■□□ 2.1
CITED1-201ENST00000246139 ATP6V1AP38606 617 aa28.19■■■□□ 2.1
CITED1-201ENST00000246139 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
CITED1-201ENST00000246139 UBR3Q6ZT12 1888 aa28.16■■■□□ 2.1
CITED1-201ENST00000246139 PHF14O94880 888 aa28.15■■■□□ 2.1
CITED1-201ENST00000246139 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.15■■■□□ 2.1
CITED1-201ENST00000246139 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
CITED1-201ENST00000246139 ITPK1Q13572 414 aa28.14■■■□□ 2.1
CITED1-201ENST00000246139 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
CITED1-201ENST00000246139 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
CITED1-201ENST00000246139 C1QTNF8P60827 252 aa28.13■■■□□ 2.09
CITED1-201ENST00000246139 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.13■■■□□ 2.09
CITED1-201ENST00000246139 CFAP53Q96M91 514 aa28.13■■■□□ 2.09
CITED1-201ENST00000246139 PPP2R1AP30153 589 aa28.12■■■□□ 2.09
CITED1-201ENST00000246139 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.12■■■□□ 2.09
CITED1-201ENST00000246139 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CITED1-201ENST00000246139 GNPATO15228 680 aa28.1■■■□□ 2.09
CITED1-201ENST00000246139 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CITED1-201ENST00000246139 CEP350Q5VT06 3117 aa28.07■■■□□ 2.08
CITED1-201ENST00000246139 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
CITED1-201ENST00000246139 SSFA2P28290 1259 aa28.07■■■□□ 2.08
CITED1-201ENST00000246139 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.07■■■□□ 2.08
CITED1-201ENST00000246139 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.06■■■□□ 2.08
CITED1-201ENST00000246139 GRIN3BO60391 1043 aa28.06■■■□□ 2.08
CITED1-201ENST00000246139 SLC4A9Q96Q91 983 aa28.06■■■□□ 2.08
CITED1-201ENST00000246139 LGR6Q9HBX8 967 aa28.05■■■□□ 2.08
CITED1-201ENST00000246139 NUDCQ9Y266 331 aa28.04■■■□□ 2.08
CITED1-201ENST00000246139 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CITED1-201ENST00000246139 RNMTO43148 476 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CITED1-201ENST00000246139 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.02■■■□□ 2.08
CITED1-201ENST00000246139 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
CITED1-201ENST00000246139 TRAPPC3LQ5T215 181 aa28.01■■■□□ 2.07
CITED1-201ENST00000246139 WWC3Q9ULE0 1092 aa28■■■□□ 2.07
CITED1-201ENST00000246139 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CITED1-201ENST00000246139 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
CITED1-201ENST00000246139 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.98■■■□□ 2.07
CITED1-201ENST00000246139 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
CITED1-201ENST00000246139 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.97■■■□□ 2.07
CITED1-201ENST00000246139 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.97■■■□□ 2.07
CITED1-201ENST00000246139 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.97■■■□□ 2.07
CITED1-201ENST00000246139 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa27.96■■■□□ 2.07
CITED1-201ENST00000246139 ATP10DQ9P241 1426 aa27.96■■■□□ 2.07
CITED1-201ENST00000246139 PRKAR2BP31323 418 aa27.96■■■□□ 2.07
CITED1-201ENST00000246139 SLC39A6Q13433 755 aa27.95■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 RPS6KA4O75676 772 aa27.94■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 RFC4P35249 363 aa27.94■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.94■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.93■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 ADRA2BP18089 450 aa27.93■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 CRKLP46109 303 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.91■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 MRC1P22897 1456 aa27.91■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 FCHSD2O94868 740 aa27.91■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 ADCY9O60503 1353 aa27.9■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 TEFQ10587 303 aa27.9■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.9■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 MMP10P09238 476 aa27.89■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 DNAJC10Q8IXB1 793 aa27.89■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 IL17REQ8NFR9 667 aa27.89■■■□□ 2.06
CITED1-201ENST00000246139 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.89■■■□□ 2.05
CITED1-201ENST00000246139 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27.88■■■□□ 2.05
CITED1-201ENST00000246139 RALBP1Q15311 655 aa27.88■■■□□ 2.05
CITED1-201ENST00000246139 TTC5Q8N0Z6 440 aa27.88■■■□□ 2.05
CITED1-201ENST00000246139 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.86■■■□□ 2.05
CITED1-201ENST00000246139 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
CITED1-201ENST00000246139 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CITED1-201ENST00000246139 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CITED1-201ENST00000246139 CCDC87Q9NVE4 849 aa27.84■■■□□ 2.05
CITED1-201ENST00000246139 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.83■■■□□ 2.05
CITED1-201ENST00000246139 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
CITED1-201ENST00000246139 GYS1P13807 737 aa27.83■■■□□ 2.05
CITED1-201ENST00000246139 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
CITED1-201ENST00000246139 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
CITED1-201ENST00000246139 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CITED1-201ENST00000246139 VSIG10Q8N0Z9 540 aa27.81■■■□□ 2.04
CITED1-201ENST00000246139 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CITED1-201ENST00000246139 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CITED1-201ENST00000246139 C4AP0C0L4 1744 aa27.81■■■□□ 2.04
CITED1-201ENST00000246139 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.8■■■□□ 2.04
CITED1-201ENST00000246139 TJP1Q07157 1748 aa27.8■■■□□ 2.04
CITED1-201ENST00000246139 KCPQ6ZWJ8 1503 aa27.79■■■□□ 2.04
CITED1-201ENST00000246139 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.79■■■□□ 2.04
CITED1-201ENST00000246139 A0A0G2JLW4 131 aa27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms