RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219302.7

NME3-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME3, Length 1,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-201ENST00000219302 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.71■■□□□ 1.07
NME3-201ENST00000219302 PANK3Q9H999 370 aa21.71■■□□□ 1.07
NME3-201ENST00000219302 ATP10DQ9P241 1426 aa21.71■■□□□ 1.07
NME3-201ENST00000219302 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.69■■□□□ 1.06
NME3-201ENST00000219302 ADCY9O60503 1353 aa21.69■■□□□ 1.06
NME3-201ENST00000219302 KDRP35968 1356 aa21.69■■□□□ 1.06
NME3-201ENST00000219302 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
NME3-201ENST00000219302 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
NME3-201ENST00000219302 DCAF5Q96JK2 942 aa21.68■■□□□ 1.06
NME3-201ENST00000219302 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
NME3-201ENST00000219302 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.67■■□□□ 1.06
NME3-201ENST00000219302 CEP350Q5VT06 3117 aa21.66■■□□□ 1.06
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NME3-201ENST00000219302 MMP10P09238 476 aa21.66■■□□□ 1.06
NME3-201ENST00000219302 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.66■■□□□ 1.06
NME3-201ENST00000219302 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
NME3-201ENST00000219302 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
NME3-201ENST00000219302 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
NME3-201ENST00000219302 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.64■■□□□ 1.05
NME3-201ENST00000219302 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.64■■□□□ 1.05
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NME3-201ENST00000219302 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
NME3-201ENST00000219302 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
NME3-201ENST00000219302 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
NME3-201ENST00000219302 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.62■■□□□ 1.05
NME3-201ENST00000219302 RPS6KA4O75676 772 aa21.62■■□□□ 1.05
NME3-201ENST00000219302 ADRA2BP18089 450 aa21.62■■□□□ 1.05
NME3-201ENST00000219302 CABP4P57796 275 aa21.62■■□□□ 1.05
NME3-201ENST00000219302 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.62■■□□□ 1.05
NME3-201ENST00000219302 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.62■■□□□ 1.05
NME3-201ENST00000219302 TGFB2P61812 414 aa21.61■■□□□ 1.05
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NME3-201ENST00000219302 GYS1P13807 737 aa21.6■■□□□ 1.05
NME3-201ENST00000219302 MTHFSP49914 203 aa21.6■■□□□ 1.05
NME3-201ENST00000219302 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
NME3-201ENST00000219302 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.59■■□□□ 1.05
NME3-201ENST00000219302 A0A0G2JLW4 131 aa21.58■■□□□ 1.05
NME3-201ENST00000219302 IL13P35225 146 aa21.58■■□□□ 1.05
NME3-201ENST00000219302 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.58■■□□□ 1.05
NME3-201ENST00000219302 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.58■■□□□ 1.05
NME3-201ENST00000219302 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
NME3-201ENST00000219302 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.57■■□□□ 1.04
NME3-201ENST00000219302 RFC4P35249 363 aa21.57■■□□□ 1.04
NME3-201ENST00000219302 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
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NME3-201ENST00000219302 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.56■■□□□ 1.04
NME3-201ENST00000219302 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.55■■□□□ 1.04
NME3-201ENST00000219302 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.55■■□□□ 1.04
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NME3-201ENST00000219302 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.54■■□□□ 1.04
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NME3-201ENST00000219302 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.49■■□□□ 1.03
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NME3-201ENST00000219302 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.47■■□□□ 1.03
NME3-201ENST00000219302 TM4SF1P30408 202 aa21.46■■□□□ 1.03
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NME3-201ENST00000219302 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NME3-201ENST00000219302 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.4■■□□□ 1.02
NME3-201ENST00000219302 MRC1P22897 1456 aa21.39■■□□□ 1.02
NME3-201ENST00000219302 ZPR1O75312 459 aa21.39■■□□□ 1.01
NME3-201ENST00000219302 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.39■■□□□ 1.01
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NME3-201ENST00000219302 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
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