RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 KCNJ4P48050 445 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 IL25Q9H293 177 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 ADGRB1O14514 1584 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 PPFIA3O75145 1194 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 MX1P20591 662 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF592Q92610 1267 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 STK31Q9BXU1 1019 aa20.23■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 PDLIM2Q96JY6 352 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDP1-201ENST00000075430 ANXA1P04083 346 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 NPHP1O15259 732 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 GNAI2P04899 355 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 METP08581 1390 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 NECAB1Q8N987 351 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 DYNC1I1O14576 645 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 BRD1O95696 1058 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 RTL1A6NKG5 1358 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 ACEP12821 1306 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 CHMLP26374 656 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 STK3Q13188 491 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF853P0CG23 659 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 NLRP6P59044 892 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 MAP7D2Q96T17 732 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 PHF14O94880 888 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 EID1Q9Y6B2 187 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 NEO1Q92859 1461 aa20.14■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.14■□□□□ 0.82
CTDP1-201ENST00000075430 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 TSPOAP1O95153 1857 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 LRRC7Q96NW7 1537 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.815e-6■□□□□ 11.3
CTDP1-201ENST00000075430 KIF3AQ9Y496 699 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 HS1BP3Q53T59 392 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 PYCARDQ9ULZ3 195 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 USHBP1Q8N6Y0 703 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 RASEFQ8IZ41 740 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.12■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 AK2P54819 239 aa20.12■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 SYT1P21579 422 aa20.11■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 ATP2B3Q16720 1220 aa20.11■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 PRDM4Q9UKN5 801 aa20.11■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 LARGE1O95461 756 aa20.11■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.1■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.1■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 SRGAP3O43295 1099 aa20.1■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 STX6O43752 255 aa20.1■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 LRMPQ12912 555 aa20.1■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 FLIIQ13045 1269 aa20.1■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 PTGS1P23219 599 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 LUZP1Q86V48 1076 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 ZBTB9Q96C00 473 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 PTCH1Q13635 1447 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 A0A087WWV3 80 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDP1-201ENST00000075430 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.09■□□□□ 0.81
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