RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Myo5bP21271 1818 aa25.57■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cntnap1O54991 1385 aa25.57■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mcm2P97310 904 aa25.57■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 DccP70211 1447 aa25.55■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf526Q8BI66 675 aa25.55■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Aldh1l2Q8K009 923 aa25.55■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Amotl2Q8K371 772 aa25.55■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa25.54■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Plcb2A3KGF7 1181 aa25.54■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa25.54■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Amotl1Q9D4H4 968 aa25.54■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Snap23O09044 210 aa25.53■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gcc1Q9D4H2 778 aa25.53■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Il4rP16382 810 aa25.52■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prim1P20664 417 aa25.52■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CenppQ9CZ92 286 aa25.52■■□□□ 1.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa25.51■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nutm1Q8BHP2 1126 aa25.51■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pknox2Q8BG99 474 aa25.51■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Abca15E9PWH4 1668 aa25.5■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pibf1E9Q6K3 756 aa25.5■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spryd3E9Q9B3 442 aa25.5■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ggt6Q6PDE7 497 aa25.5■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa25.5■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nid2O88322 1403 aa25.5■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm21698A0A087WQP8 267 aa25.49■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm21671G3UY31 267 aa25.49■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igsf1Q7TQA1 1317 aa25.49■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trim27Q62158 513 aa25.49■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ddrgk1Q80WW9 315 aa25.48■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MypopQ8R4U1 393 aa25.47■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Casq1O09165 405 aa25.47■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Chl1P70232 1209 aa25.47■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ric3Q8BPM6 367 aa25.47■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lrp6O88572 1613 aa25.46■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TkfcQ8VC30 578 aa25.45■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Simc1E9Q6E9 1354 aa25.44■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bcl9lQ67FY2 1494 aa25.44■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Abcc12Q80WJ6 1366 aa25.44■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rnf123Q5XPI3 1314 aa25.43■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rfx1P48377 963 aa25.43■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Card10P58660 1021 aa25.43■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nek4Q9Z1J2 792 aa25.43■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q3TQI7 289 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trim44Q9QXA7 346 aa25.42■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10471E9Q1C7 252 aa25.41■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 EngaseQ8BX80 734 aa25.41■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dlg5E9Q9R9 1921 aa25.41■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dmrt2Q8BG36 561 aa25.4■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Col15a1O35206 1367 aa25.4■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 FocadA2AKG8 1798 aa25.4■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 OptnQ8K3K8 584 aa25.4■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tm6sf1P58749 370 aa25.39■■□□□ 1.66
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ImpactO55091 318 aa25.38■■□□□ 1.65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa25.38■■□□□ 1.65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hoxa7P02830 229 aa25.38■■□□□ 1.65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CrklP47941 303 aa25.38■■□□□ 1.65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa25.38■■□□□ 1.65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sv2bQ8BG39 683 aa25.37■■□□□ 1.65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmx3Q8BXZ1 456 aa25.37■■□□□ 1.65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bag4Q8CI61 457 aa25.37■■□□□ 1.65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Aox2Q5SGK3 1345 aa25.37■■□□□ 1.65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp10bB1AWN4 1474 aa25.36■■□□□ 1.65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pdcl2Q78Y63 240 aa25.36■■□□□ 1.65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smim5Q8BT42 78 aa25.35■■□□□ 1.65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cadps2Q8BYR5 1297 aa25.35■■□□□ 1.65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tnks1bp1P58871 1720 aa25.34■■□□□ 1.65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atf5O70191 283 aa25.34■■□□□ 1.65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tpm2P58774 284 aa25.34■■□□□ 1.65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Aifm3Q3TY86 605 aa25.34■■□□□ 1.65
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Chpf2Q3UU43 768 aa25.32■■□□□ 1.64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Clcn1Q64347 994 aa25.32■■□□□ 1.64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp6r3Q922D4 844 aa25.32■■□□□ 1.64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slit1Q80TR4 1531 aa25.31■■□□□ 1.64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Aplp1Q03157 653 aa25.3■■□□□ 1.64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zranb3Q6NZP1 1069 aa25.3■■□□□ 1.64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Phf23Q8BSN5 401 aa25.3■■□□□ 1.64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tnnt1O88346 262 aa25.3■■□□□ 1.64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HdgfP51859 237 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ThemisQ8BGW0 636 aa25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 181.8 ms