Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
SETBP1Q9Y6X0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
SETBP1Q9Y6X0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
SETBP1Q9Y6X0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
SETBP1Q9Y6X0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
SETBP1Q9Y6X0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
SETBP1Q9Y6X0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SETBP1Q9Y6X0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
SETBP1Q9Y6X0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SETBP1Q9Y6X0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
SETBP1Q9Y6X0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
SETBP1Q9Y6X0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SETBP1Q9Y6X0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
SETBP1Q9Y6X0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SETBP1Q9Y6X0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SETBP1Q9Y6X0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
SETBP1Q9Y6X0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
SETBP1Q9Y6X0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
SETBP1Q9Y6X0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
SETBP1Q9Y6X0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
SETBP1Q9Y6X0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC41.76■■■■■ 4.27
SETBP1Q9Y6X0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
SETBP1Q9Y6X0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
SETBP1Q9Y6X0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
SETBP1Q9Y6X0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SETBP1Q9Y6X0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SETBP1Q9Y6X0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
SETBP1Q9Y6X0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
SETBP1Q9Y6X0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SETBP1Q9Y6X0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SETBP1Q9Y6X0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.24
SETBP1Q9Y6X0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
SETBP1Q9Y6X0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC41.53■■■■■ 4.24
SETBP1Q9Y6X0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
SETBP1Q9Y6X0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
SETBP1Q9Y6X0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
SETBP1Q9Y6X0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
SETBP1Q9Y6X0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
SETBP1Q9Y6X0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC41.38■■■■■ 4.22
SETBP1Q9Y6X0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC41.38■■■■■ 4.22
SETBP1Q9Y6X0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
SETBP1Q9Y6X0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
SETBP1Q9Y6X0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
SETBP1Q9Y6X0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
SETBP1Q9Y6X0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
SETBP1Q9Y6X0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
SETBP1Q9Y6X0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
SETBP1Q9Y6X0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SETBP1Q9Y6X0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
SETBP1Q9Y6X0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
SETBP1Q9Y6X0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC41.23■■■■■ 4.19
SETBP1Q9Y6X0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
SETBP1Q9Y6X0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
SETBP1Q9Y6X0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
SETBP1Q9Y6X0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SETBP1Q9Y6X0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
SETBP1Q9Y6X0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
SETBP1Q9Y6X0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
SETBP1Q9Y6X0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
SETBP1Q9Y6X0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SETBP1Q9Y6X0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
SETBP1Q9Y6X0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
SETBP1Q9Y6X0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SETBP1Q9Y6X0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
SETBP1Q9Y6X0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
SETBP1Q9Y6X0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
SETBP1Q9Y6X0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
SETBP1Q9Y6X0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
SETBP1Q9Y6X0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
SETBP1Q9Y6X0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
SETBP1Q9Y6X0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
SETBP1Q9Y6X0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SETBP1Q9Y6X0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
SETBP1Q9Y6X0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SETBP1Q9Y6X0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
SETBP1Q9Y6X0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
SETBP1Q9Y6X0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.11
SETBP1Q9Y6X0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC40.69■■■■■ 4.11
SETBP1Q9Y6X0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
SETBP1Q9Y6X0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SETBP1Q9Y6X0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
SETBP1Q9Y6X0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
SETBP1Q9Y6X0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SETBP1Q9Y6X0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SETBP1Q9Y6X0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SETBP1Q9Y6X0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SETBP1Q9Y6X0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SETBP1Q9Y6X0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
SETBP1Q9Y6X0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
SETBP1Q9Y6X0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
SETBP1Q9Y6X0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
SETBP1Q9Y6X0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
SETBP1Q9Y6X0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SETBP1Q9Y6X0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
SETBP1Q9Y6X0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SETBP1Q9Y6X0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
SETBP1Q9Y6X0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SETBP1Q9Y6X0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SETBP1Q9Y6X0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
SETBP1Q9Y6X0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms