Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y606

PUS1, tRNA pseudouridine synthase A, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1Q9Y606 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14not detected
PUS1Q9Y606 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96not detected
PUS1Q9Y606 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83not detected
PUS1Q9Y606 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8not detected
PUS1Q9Y606 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8not detected
PUS1Q9Y606 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76not detected
PUS1Q9Y606 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76not detected
PUS1Q9Y606 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76not detected
PUS1Q9Y606 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7not detected
PUS1Q9Y606 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68not detected
PUS1Q9Y606 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68not detected
PUS1Q9Y606 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68not detected
PUS1Q9Y606 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67not detected
PUS1Q9Y606 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66not detected
PUS1Q9Y606 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65not detected
PUS1Q9Y606 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65not detected
PUS1Q9Y606 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64not detected
PUS1Q9Y606 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63not detected
PUS1Q9Y606 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62not detected
PUS1Q9Y606 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61not detected
PUS1Q9Y606 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59not detected
PUS1Q9Y606 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58not detected
PUS1Q9Y606 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58not detected
PUS1Q9Y606 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58not detected
PUS1Q9Y606 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57not detected
PUS1Q9Y606 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56not detected
PUS1Q9Y606 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55not detected
PUS1Q9Y606 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55not detected
PUS1Q9Y606 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53not detected
PUS1Q9Y606 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51not detected
PUS1Q9Y606 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51not detected
PUS1Q9Y606 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51not detected
PUS1Q9Y606 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5not detected
PUS1Q9Y606 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5not detected
PUS1Q9Y606 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49not detected
PUS1Q9Y606 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48not detected
PUS1Q9Y606 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48not detected
PUS1Q9Y606 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48not detected
PUS1Q9Y606 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47not detected
PUS1Q9Y606 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46not detected
PUS1Q9Y606 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45not detected
PUS1Q9Y606 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45not detected
PUS1Q9Y606 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44not detected
PUS1Q9Y606 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44not detected
PUS1Q9Y606 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44not detected
PUS1Q9Y606 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44not detected
PUS1Q9Y606 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43not detected
PUS1Q9Y606 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43not detected
PUS1Q9Y606 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43not detected
PUS1Q9Y606 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43not detected
PUS1Q9Y606 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42not detected
PUS1Q9Y606 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42not detected
PUS1Q9Y606 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41not detected
PUS1Q9Y606 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41not detected
PUS1Q9Y606 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41not detected
PUS1Q9Y606 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41not detected
PUS1Q9Y606 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41not detected
PUS1Q9Y606 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4not detected
PUS1Q9Y606 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4not detected
PUS1Q9Y606 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4not detected
PUS1Q9Y606 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4not detected
PUS1Q9Y606 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39not detected
PUS1Q9Y606 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39not detected
PUS1Q9Y606 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39not detected
PUS1Q9Y606 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39not detected
PUS1Q9Y606 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38not detected
PUS1Q9Y606 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38not detected
PUS1Q9Y606 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38not detected
PUS1Q9Y606 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38not detected
PUS1Q9Y606 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37not detected
PUS1Q9Y606 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37not detected
PUS1Q9Y606 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37not detected
PUS1Q9Y606 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37not detected
PUS1Q9Y606 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37not detected
PUS1Q9Y606 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37not detected
PUS1Q9Y606 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36not detected
PUS1Q9Y606 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36not detected
PUS1Q9Y606 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36not detected
PUS1Q9Y606 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36not detected
PUS1Q9Y606 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36not detected
PUS1Q9Y606 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35not detected
PUS1Q9Y606 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35not detected
PUS1Q9Y606 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34not detected
PUS1Q9Y606 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34not detected
PUS1Q9Y606 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33not detected
PUS1Q9Y606 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33not detected
PUS1Q9Y606 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33not detected
PUS1Q9Y606 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33not detected
PUS1Q9Y606 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33not detected
PUS1Q9Y606 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32not detected
PUS1Q9Y606 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32not detected
PUS1Q9Y606 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32not detected
PUS1Q9Y606 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31not detected
PUS1Q9Y606 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31not detected
PUS1Q9Y606 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31not detected
PUS1Q9Y606 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31not detected
PUS1Q9Y606 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3not detected
PUS1Q9Y606 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3not detected
PUS1Q9Y606 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3not detected
PUS1Q9Y606 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3not detected
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms