Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 RPS3-219ENST00000534440 564 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.657e-40■□□□□ 10.1
UTP18Q9Y5J1 RPS3-210ENST00000528439 473 ntTSL 310.96□□□□□ -0.657e-40■□□□□ 10.1
UTP18Q9Y5J1 RPS3-203ENST00000524851 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.767e-40■□□□□ 10.1
UTP18Q9Y5J1 RPS3-214ENST00000530164 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.767e-40■□□□□ 10.1
UTP18Q9Y5J1 RPS3-211ENST00000528847 639 ntTSL 510.1□□□□□ -0.797e-40■□□□□ 10.1
UTP18Q9Y5J1 RPS3-207ENST00000526608 710 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.947e-40■□□□□ 10.1
UTP18Q9Y5J1 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC7.93□□□□□ -1.147e-40■□□□□ 10.1
UTP18Q9Y5J1 RPL23A-209ENST00000582736 595 ntTSL 1 (best)14.93□□□□□ -0.022e-39■■□□□ 14.5
UTP18Q9Y5J1 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.41□□□□□ -2.342e-39■■□□□ 14.5
UTP18Q9Y5J1 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.962e-37■■■■□ 24.9
UTP18Q9Y5J1 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.39□□□□□ -1.871e-34■■■□□ 14.6
UTP18Q9Y5J1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.25■■□□□ 1.793e-32■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 DANCR-203ENST00000441504 336 ntTSL 218.53■□□□□ 0.563e-32■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.453e-32■□□□□ 9.4
UTP18Q9Y5J1 RPS11-206ENST00000600027 944 ntTSL 512.95□□□□□ -0.345e-30■□□□□ 10.7
UTP18Q9Y5J1 RPS11-204ENST00000599167 1133 ntTSL 512.95□□□□□ -0.345e-30■□□□□ 10.7
UTP18Q9Y5J1 RPS11-201ENST00000270625 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.855e-30■□□□□ 10.7
UTP18Q9Y5J1 RPS11-207ENST00000601216 602 ntTSL 49.66□□□□□ -0.865e-30■□□□□ 10.7
UTP18Q9Y5J1 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -15e-30■□□□□ 10.7
UTP18Q9Y5J1 RPS11-209ENST00000602252 751 ntTSL 28.8□□□□□ -15e-30■□□□□ 10.7
UTP18Q9Y5J1 RPS11-208ENST00000601306 547 ntTSL 38.31□□□□□ -1.085e-30■□□□□ 10.7
UTP18Q9Y5J1 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.125e-30■□□□□ 10.7
UTP18Q9Y5J1 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.275e-30■□□□□ 10.7
UTP18Q9Y5J1 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.46□□□□□ -1.75e-30■□□□□ 10.7
UTP18Q9Y5J1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.397e-30■■□□□ 11.5
UTP18Q9Y5J1 SRRM2-218ENST00000574331 1759 ntTSL 219.4■□□□□ 0.72e-29■□□□□ 11.2
UTP18Q9Y5J1 SRRM2-221ENST00000574866 638 ntTSL 319.37■□□□□ 0.692e-29■□□□□ 11.2
UTP18Q9Y5J1 SRRM2-220ENST00000574593 1440 ntTSL 316.63■□□□□ 0.252e-29■■■■□ 22.8
UTP18Q9Y5J1 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.86□□□□□ -2.111e-28■■□□□ 11.5
UTP18Q9Y5J1 ACER3-214ENST00000534206 834 ntTSL 529.48■■■□□ 2.316e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-204ENST00000525861 2058 ntTSL 225.56■■□□□ 1.686e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-211ENST00000531461 1292 ntTSL 224.88■■□□□ 1.576e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-207ENST00000530182 551 ntTSL 524.85■■□□□ 1.576e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-202ENST00000525194 846 ntTSL 1 (best)24.1■■□□□ 1.456e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-201ENST00000278544 3500 ntTSL 1 (best)14.59□□□□□ -0.076e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.336e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-210ENST00000531352 2093 ntTSL 1 (best)12.49□□□□□ -0.416e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-212ENST00000532485 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.866e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.256e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-208ENST00000530334 931 ntTSL 25.92□□□□□ -1.466e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 RBMX-204ENST00000464781 1852 ntTSL 215.31■□□□□ 0.041e-27■□□□□ 11.3
UTP18Q9Y5J1 RBMX-210ENST00000565907 563 ntTSL 215.23■□□□□ 0.031e-27■□□□□ 11.3
UTP18Q9Y5J1 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.191e-27■□□□□ 11.3
UTP18Q9Y5J1 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.221e-27■□□□□ 11.3
UTP18Q9Y5J1 RBMX-211ENST00000567262 477 ntTSL 512.95□□□□□ -0.341e-27■□□□□ 11.3
UTP18Q9Y5J1 RBMX-208ENST00000563370 577 ntTSL 312.95□□□□□ -0.341e-27■□□□□ 11.3
UTP18Q9Y5J1 RBMX-212ENST00000568578 4887 ntTSL 1 (best)10.7□□□□□ -0.71e-27■□□□□ 11.3
UTP18Q9Y5J1 RBMX-207ENST00000562646 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.771e-27■□□□□ 11.3
UTP18Q9Y5J1 RBMX-202ENST00000419968 940 ntTSL 59.71□□□□□ -0.861e-27■□□□□ 11.3
UTP18Q9Y5J1 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.461e-27■□□□□ 11.3
UTP18Q9Y5J1 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.97□□□□□ -2.091e-27■□□□□ 11.3
UTP18Q9Y5J1 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC8.3□□□□□ -1.082e-27■■■□□ 17.1
UTP18Q9Y5J1 SNORD91A-201ENST00000390861 95 nt1.61□□□□□ -2.152e-27■■■□□ 17.1
UTP18Q9Y5J1 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.62e-26■□□□□ 8.8
UTP18Q9Y5J1 EIF4A2-215ENST00000467585 570 ntTSL 213.78□□□□□ -0.22e-26■□□□□ 10.5
UTP18Q9Y5J1 EIF4A2-208ENST00000445596 600 ntTSL 212.55□□□□□ -0.42e-26■□□□□ 10.5
UTP18Q9Y5J1 EIF4A2-201ENST00000323963 1919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.642e-26■□□□□ 10.5
UTP18Q9Y5J1 EIF4A2-227ENST00000498746 579 ntTSL 211.08□□□□□ -0.642e-26■□□□□ 10.5
UTP18Q9Y5J1 EIF4A2-203ENST00000426808 1751 ntTSL 1 (best)8.19□□□□□ -1.12e-26■□□□□ 10.5
UTP18Q9Y5J1 EIF4A2-207ENST00000443963 1729 ntTSL 1 (best)7.42□□□□□ -1.222e-26■□□□□ 10.5
UTP18Q9Y5J1 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.262e-26■□□□□ 10.5
UTP18Q9Y5J1 EIF4A2-211ENST00000465222 676 ntTSL 26.85□□□□□ -1.312e-26■□□□□ 10.5
UTP18Q9Y5J1 EIF4A2-212ENST00000465267 1054 ntTSL 26.8□□□□□ -1.322e-26■□□□□ 10.5
UTP18Q9Y5J1 EIF4A2-221ENST00000491473 579 ntTSL 26.8□□□□□ -1.322e-26■□□□□ 10.5
UTP18Q9Y5J1 EIF4A2-202ENST00000425053 1977 ntTSL 56.36□□□□□ -1.392e-26■□□□□ 10.5
UTP18Q9Y5J1 EIF4A2-204ENST00000429589 1005 ntTSL 56.03□□□□□ -1.442e-26■□□□□ 10.5
UTP18Q9Y5J1 EIF4A2-224ENST00000495049 576 ntTSL 26.03□□□□□ -1.442e-26■□□□□ 10.5
UTP18Q9Y5J1 EIF4A2-210ENST00000465032 578 ntTSL 26.03□□□□□ -1.442e-26■□□□□ 10.5
UTP18Q9Y5J1 EIF4A2-218ENST00000475653 909 ntTSL 26□□□□□ -1.452e-26■□□□□ 10.5
UTP18Q9Y5J1 EIF4A2-219ENST00000485101 5327 ntTSL 54.73□□□□□ -1.652e-26■□□□□ 10.5
UTP18Q9Y5J1 EIF4A2-220ENST00000486805 590 ntTSL 23.18□□□□□ -1.92e-26■□□□□ 10.5
UTP18Q9Y5J1 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.04□□□□□ -2.42e-26■□□□□ 10.5
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.072e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-216ENST00000541416 996 ntTSL 212.54□□□□□ -0.42e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-206ENST00000537925 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.462e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-209ENST00000538654 2768 ntTSL 29.76□□□□□ -0.852e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-223ENST00000545440 754 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.122e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.292e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.32e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.322e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-224ENST00000545688 610 ntTSL 36.11□□□□□ -1.432e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.442e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-207ENST00000537965 578 ntTSL 55.39□□□□□ -1.552e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.552e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.612e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.642e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.672e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-222ENST00000545308 646 ntTSL 24.59□□□□□ -1.672e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-214ENST00000540865 784 ntTSL 54.5□□□□□ -1.692e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-203ENST00000537024 532 ntTSL 54.39□□□□□ -1.712e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-202ENST00000535689 550 ntTSL 24.01□□□□□ -1.772e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-220ENST00000544550 636 ntTSL 23.93□□□□□ -1.782e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.832e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.78□□□□□ -2.282e-26■□□□□ 8.9
UTP18Q9Y5J1 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.632e-26■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RABGGTB-208ENST00000471759 2137 ntTSL 27.69□□□□□ -1.182e-26■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RABGGTB-205ENST00000462042 569 ntTSL 36.79□□□□□ -1.322e-26■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RABGGTB-212ENST00000491266 961 ntTSL 36.61□□□□□ -1.352e-26■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RABGGTB-209ENST00000473406 721 ntTSL 56.55□□□□□ -1.362e-26■□□□□ 9.2
UTP18Q9Y5J1 RABGGTB-204ENST00000461653 1702 ntTSL 55.4□□□□□ -1.552e-26■□□□□ 9.2
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