Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S0

B9d1, B9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B9d1Q9R1S0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
B9d1Q9R1S0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
B9d1Q9R1S0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
B9d1Q9R1S0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
B9d1Q9R1S0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
B9d1Q9R1S0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
B9d1Q9R1S0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
B9d1Q9R1S0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
B9d1Q9R1S0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
B9d1Q9R1S0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
B9d1Q9R1S0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
B9d1Q9R1S0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
B9d1Q9R1S0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
B9d1Q9R1S0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
B9d1Q9R1S0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
B9d1Q9R1S0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
B9d1Q9R1S0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
B9d1Q9R1S0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
B9d1Q9R1S0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
B9d1Q9R1S0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
B9d1Q9R1S0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
B9d1Q9R1S0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
B9d1Q9R1S0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
B9d1Q9R1S0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
B9d1Q9R1S0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
B9d1Q9R1S0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
B9d1Q9R1S0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
B9d1Q9R1S0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
B9d1Q9R1S0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
B9d1Q9R1S0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
B9d1Q9R1S0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
B9d1Q9R1S0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
B9d1Q9R1S0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
B9d1Q9R1S0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
B9d1Q9R1S0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
B9d1Q9R1S0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
B9d1Q9R1S0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
B9d1Q9R1S0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
B9d1Q9R1S0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
B9d1Q9R1S0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
B9d1Q9R1S0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
B9d1Q9R1S0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
B9d1Q9R1S0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
B9d1Q9R1S0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
B9d1Q9R1S0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
B9d1Q9R1S0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
B9d1Q9R1S0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
B9d1Q9R1S0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
B9d1Q9R1S0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
B9d1Q9R1S0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
B9d1Q9R1S0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
B9d1Q9R1S0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
B9d1Q9R1S0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
B9d1Q9R1S0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
B9d1Q9R1S0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
B9d1Q9R1S0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
B9d1Q9R1S0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
B9d1Q9R1S0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
B9d1Q9R1S0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
B9d1Q9R1S0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
B9d1Q9R1S0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
B9d1Q9R1S0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
B9d1Q9R1S0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
B9d1Q9R1S0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
B9d1Q9R1S0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
B9d1Q9R1S0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
B9d1Q9R1S0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
B9d1Q9R1S0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
B9d1Q9R1S0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
B9d1Q9R1S0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
B9d1Q9R1S0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
B9d1Q9R1S0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
B9d1Q9R1S0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
B9d1Q9R1S0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
B9d1Q9R1S0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
B9d1Q9R1S0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
B9d1Q9R1S0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
B9d1Q9R1S0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
B9d1Q9R1S0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
B9d1Q9R1S0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
B9d1Q9R1S0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
B9d1Q9R1S0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
B9d1Q9R1S0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
B9d1Q9R1S0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
B9d1Q9R1S0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
B9d1Q9R1S0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
B9d1Q9R1S0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
B9d1Q9R1S0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
B9d1Q9R1S0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
B9d1Q9R1S0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
B9d1Q9R1S0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
B9d1Q9R1S0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
B9d1Q9R1S0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
B9d1Q9R1S0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
B9d1Q9R1S0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
B9d1Q9R1S0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
B9d1Q9R1S0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
B9d1Q9R1S0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
B9d1Q9R1S0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
B9d1Q9R1S0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms