Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX4

MYO5C, Unconventional myosin-Vc, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5CQ9NQX4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
MYO5CQ9NQX4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
MYO5CQ9NQX4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC45.57■■■■■ 4.89
MYO5CQ9NQX4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.87
MYO5CQ9NQX4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.87
MYO5CQ9NQX4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC45.48■■■■■ 4.87
MYO5CQ9NQX4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.86
MYO5CQ9NQX4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
MYO5CQ9NQX4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
MYO5CQ9NQX4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
MYO5CQ9NQX4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.85
MYO5CQ9NQX4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC45.35■■■■■ 4.85
MYO5CQ9NQX4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
MYO5CQ9NQX4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
MYO5CQ9NQX4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
MYO5CQ9NQX4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
MYO5CQ9NQX4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC45.29■■■■■ 4.84
MYO5CQ9NQX4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
MYO5CQ9NQX4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
MYO5CQ9NQX4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
MYO5CQ9NQX4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
MYO5CQ9NQX4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC45.12■■■■■ 4.81
MYO5CQ9NQX4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
MYO5CQ9NQX4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
MYO5CQ9NQX4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
MYO5CQ9NQX4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
MYO5CQ9NQX4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC44.94■■■■■ 4.78
MYO5CQ9NQX4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.78
MYO5CQ9NQX4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
MYO5CQ9NQX4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
MYO5CQ9NQX4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
MYO5CQ9NQX4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
MYO5CQ9NQX4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
MYO5CQ9NQX4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC44.81■■■■■ 4.76
MYO5CQ9NQX4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
MYO5CQ9NQX4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC44.78■■■■■ 4.76
MYO5CQ9NQX4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
MYO5CQ9NQX4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
MYO5CQ9NQX4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
MYO5CQ9NQX4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC44.68■■■■■ 4.74
MYO5CQ9NQX4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
MYO5CQ9NQX4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
MYO5CQ9NQX4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
MYO5CQ9NQX4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
MYO5CQ9NQX4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC44.62■■■■■ 4.73
MYO5CQ9NQX4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
MYO5CQ9NQX4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
MYO5CQ9NQX4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
MYO5CQ9NQX4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC44.56■■■■■ 4.72
MYO5CQ9NQX4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
MYO5CQ9NQX4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC44.51■■■■■ 4.72
MYO5CQ9NQX4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
MYO5CQ9NQX4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
MYO5CQ9NQX4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC44.44■■■■■ 4.71
MYO5CQ9NQX4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
MYO5CQ9NQX4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC44.41■■■■■ 4.7
MYO5CQ9NQX4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
MYO5CQ9NQX4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
MYO5CQ9NQX4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
MYO5CQ9NQX4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
MYO5CQ9NQX4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
MYO5CQ9NQX4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
MYO5CQ9NQX4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
MYO5CQ9NQX4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC44.21■■■■■ 4.67
MYO5CQ9NQX4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
MYO5CQ9NQX4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC44.17■■■■■ 4.66
MYO5CQ9NQX4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
MYO5CQ9NQX4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
MYO5CQ9NQX4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC44.11■■■■■ 4.65
MYO5CQ9NQX4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
MYO5CQ9NQX4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
MYO5CQ9NQX4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
MYO5CQ9NQX4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
MYO5CQ9NQX4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
MYO5CQ9NQX4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
MYO5CQ9NQX4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
MYO5CQ9NQX4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
MYO5CQ9NQX4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
MYO5CQ9NQX4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
MYO5CQ9NQX4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
MYO5CQ9NQX4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
MYO5CQ9NQX4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
MYO5CQ9NQX4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
MYO5CQ9NQX4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
MYO5CQ9NQX4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
MYO5CQ9NQX4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
MYO5CQ9NQX4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
MYO5CQ9NQX4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
MYO5CQ9NQX4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC43.8■■■■■ 4.6
MYO5CQ9NQX4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
MYO5CQ9NQX4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC43.8■■■■■ 4.6
MYO5CQ9NQX4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
MYO5CQ9NQX4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
MYO5CQ9NQX4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
MYO5CQ9NQX4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
MYO5CQ9NQX4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC43.72■■■■■ 4.59
MYO5CQ9NQX4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
MYO5CQ9NQX4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
MYO5CQ9NQX4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC43.69■■■■■ 4.58
MYO5CQ9NQX4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms