Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P8

Llcfc1, LLLL and CFNLAS motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Llcfc1Q9D9P8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Llcfc1Q9D9P8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Llcfc1Q9D9P8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Llcfc1Q9D9P8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Llcfc1Q9D9P8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Llcfc1Q9D9P8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Llcfc1Q9D9P8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Llcfc1Q9D9P8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Llcfc1Q9D9P8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Llcfc1Q9D9P8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Llcfc1Q9D9P8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Llcfc1Q9D9P8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Llcfc1Q9D9P8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Llcfc1Q9D9P8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Llcfc1Q9D9P8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Llcfc1Q9D9P8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Llcfc1Q9D9P8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Llcfc1Q9D9P8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Llcfc1Q9D9P8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Llcfc1Q9D9P8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Llcfc1Q9D9P8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Llcfc1Q9D9P8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Llcfc1Q9D9P8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Llcfc1Q9D9P8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Llcfc1Q9D9P8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Llcfc1Q9D9P8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Llcfc1Q9D9P8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Llcfc1Q9D9P8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Llcfc1Q9D9P8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Llcfc1Q9D9P8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Llcfc1Q9D9P8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Llcfc1Q9D9P8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Llcfc1Q9D9P8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Llcfc1Q9D9P8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Llcfc1Q9D9P8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Llcfc1Q9D9P8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Llcfc1Q9D9P8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Llcfc1Q9D9P8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Llcfc1Q9D9P8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Llcfc1Q9D9P8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Llcfc1Q9D9P8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Llcfc1Q9D9P8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Llcfc1Q9D9P8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Llcfc1Q9D9P8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Llcfc1Q9D9P8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Llcfc1Q9D9P8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Llcfc1Q9D9P8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Llcfc1Q9D9P8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Llcfc1Q9D9P8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Llcfc1Q9D9P8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Llcfc1Q9D9P8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Llcfc1Q9D9P8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Llcfc1Q9D9P8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Llcfc1Q9D9P8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Llcfc1Q9D9P8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Llcfc1Q9D9P8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Llcfc1Q9D9P8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Llcfc1Q9D9P8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Llcfc1Q9D9P8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Llcfc1Q9D9P8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Llcfc1Q9D9P8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Llcfc1Q9D9P8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Llcfc1Q9D9P8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Llcfc1Q9D9P8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Llcfc1Q9D9P8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Llcfc1Q9D9P8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Llcfc1Q9D9P8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Llcfc1Q9D9P8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Llcfc1Q9D9P8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Llcfc1Q9D9P8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Llcfc1Q9D9P8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Llcfc1Q9D9P8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Llcfc1Q9D9P8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Llcfc1Q9D9P8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Llcfc1Q9D9P8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Llcfc1Q9D9P8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Llcfc1Q9D9P8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Llcfc1Q9D9P8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Llcfc1Q9D9P8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Llcfc1Q9D9P8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Llcfc1Q9D9P8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Llcfc1Q9D9P8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Llcfc1Q9D9P8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Llcfc1Q9D9P8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Llcfc1Q9D9P8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Llcfc1Q9D9P8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Llcfc1Q9D9P8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Llcfc1Q9D9P8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Llcfc1Q9D9P8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Llcfc1Q9D9P8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Llcfc1Q9D9P8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Llcfc1Q9D9P8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Llcfc1Q9D9P8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Llcfc1Q9D9P8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Llcfc1Q9D9P8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Llcfc1Q9D9P8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Llcfc1Q9D9P8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Llcfc1Q9D9P8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Llcfc1Q9D9P8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Llcfc1Q9D9P8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms