Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Chmp5Q9D7S9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Chmp5Q9D7S9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Chmp5Q9D7S9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Chmp5Q9D7S9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Chmp5Q9D7S9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Chmp5Q9D7S9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Chmp5Q9D7S9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Chmp5Q9D7S9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Chmp5Q9D7S9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Chmp5Q9D7S9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Chmp5Q9D7S9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Chmp5Q9D7S9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Chmp5Q9D7S9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Chmp5Q9D7S9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Chmp5Q9D7S9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Chmp5Q9D7S9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Chmp5Q9D7S9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Chmp5Q9D7S9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Chmp5Q9D7S9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Chmp5Q9D7S9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Chmp5Q9D7S9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Chmp5Q9D7S9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Chmp5Q9D7S9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Chmp5Q9D7S9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Chmp5Q9D7S9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Chmp5Q9D7S9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Chmp5Q9D7S9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Chmp5Q9D7S9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Chmp5Q9D7S9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Chmp5Q9D7S9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Chmp5Q9D7S9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Chmp5Q9D7S9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Chmp5Q9D7S9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Chmp5Q9D7S9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Chmp5Q9D7S9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Chmp5Q9D7S9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Chmp5Q9D7S9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Chmp5Q9D7S9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Chmp5Q9D7S9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Chmp5Q9D7S9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Chmp5Q9D7S9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Chmp5Q9D7S9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Chmp5Q9D7S9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Chmp5Q9D7S9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Chmp5Q9D7S9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Chmp5Q9D7S9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Chmp5Q9D7S9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Chmp5Q9D7S9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Chmp5Q9D7S9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Chmp5Q9D7S9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Chmp5Q9D7S9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Chmp5Q9D7S9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Chmp5Q9D7S9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Chmp5Q9D7S9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Chmp5Q9D7S9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Chmp5Q9D7S9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Chmp5Q9D7S9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Chmp5Q9D7S9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Chmp5Q9D7S9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Chmp5Q9D7S9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Chmp5Q9D7S9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Chmp5Q9D7S9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Chmp5Q9D7S9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Chmp5Q9D7S9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Chmp5Q9D7S9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Chmp5Q9D7S9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Chmp5Q9D7S9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Chmp5Q9D7S9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Chmp5Q9D7S9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Chmp5Q9D7S9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Chmp5Q9D7S9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Chmp5Q9D7S9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Chmp5Q9D7S9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Chmp5Q9D7S9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Chmp5Q9D7S9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Chmp5Q9D7S9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Chmp5Q9D7S9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Chmp5Q9D7S9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Chmp5Q9D7S9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Chmp5Q9D7S9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Chmp5Q9D7S9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Chmp5Q9D7S9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Chmp5Q9D7S9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Chmp5Q9D7S9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Chmp5Q9D7S9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Chmp5Q9D7S9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Chmp5Q9D7S9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Chmp5Q9D7S9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Chmp5Q9D7S9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Chmp5Q9D7S9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Chmp5Q9D7S9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Chmp5Q9D7S9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Chmp5Q9D7S9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Chmp5Q9D7S9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Chmp5Q9D7S9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Chmp5Q9D7S9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Chmp5Q9D7S9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms