Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cdca7Q9D0M2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cdca7Q9D0M2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Cdca7Q9D0M2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cdca7Q9D0M2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cdca7Q9D0M2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cdca7Q9D0M2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cdca7Q9D0M2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cdca7Q9D0M2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cdca7Q9D0M2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cdca7Q9D0M2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cdca7Q9D0M2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cdca7Q9D0M2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cdca7Q9D0M2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cdca7Q9D0M2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cdca7Q9D0M2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cdca7Q9D0M2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cdca7Q9D0M2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cdca7Q9D0M2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cdca7Q9D0M2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cdca7Q9D0M2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cdca7Q9D0M2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cdca7Q9D0M2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cdca7Q9D0M2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cdca7Q9D0M2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cdca7Q9D0M2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cdca7Q9D0M2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cdca7Q9D0M2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cdca7Q9D0M2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cdca7Q9D0M2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cdca7Q9D0M2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cdca7Q9D0M2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdca7Q9D0M2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cdca7Q9D0M2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cdca7Q9D0M2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cdca7Q9D0M2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cdca7Q9D0M2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cdca7Q9D0M2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Cdca7Q9D0M2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Cdca7Q9D0M2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cdca7Q9D0M2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Cdca7Q9D0M2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cdca7Q9D0M2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cdca7Q9D0M2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cdca7Q9D0M2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cdca7Q9D0M2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cdca7Q9D0M2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cdca7Q9D0M2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cdca7Q9D0M2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cdca7Q9D0M2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cdca7Q9D0M2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Cdca7Q9D0M2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cdca7Q9D0M2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cdca7Q9D0M2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cdca7Q9D0M2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cdca7Q9D0M2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Cdca7Q9D0M2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cdca7Q9D0M2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cdca7Q9D0M2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cdca7Q9D0M2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cdca7Q9D0M2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cdca7Q9D0M2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cdca7Q9D0M2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cdca7Q9D0M2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cdca7Q9D0M2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cdca7Q9D0M2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cdca7Q9D0M2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cdca7Q9D0M2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cdca7Q9D0M2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cdca7Q9D0M2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cdca7Q9D0M2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cdca7Q9D0M2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cdca7Q9D0M2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cdca7Q9D0M2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cdca7Q9D0M2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Cdca7Q9D0M2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cdca7Q9D0M2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cdca7Q9D0M2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cdca7Q9D0M2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cdca7Q9D0M2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cdca7Q9D0M2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cdca7Q9D0M2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cdca7Q9D0M2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cdca7Q9D0M2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cdca7Q9D0M2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cdca7Q9D0M2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cdca7Q9D0M2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cdca7Q9D0M2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cdca7Q9D0M2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cdca7Q9D0M2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cdca7Q9D0M2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Cdca7Q9D0M2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cdca7Q9D0M2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cdca7Q9D0M2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cdca7Q9D0M2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cdca7Q9D0M2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Cdca7Q9D0M2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cdca7Q9D0M2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cdca7Q9D0M2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cdca7Q9D0M2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms