Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR24

Nudt8, Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 8, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt8Q9CR24 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
Nudt8Q9CR24 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Nudt8Q9CR24 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Nudt8Q9CR24 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Nudt8Q9CR24 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Nudt8Q9CR24 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Nudt8Q9CR24 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Nudt8Q9CR24 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Nudt8Q9CR24 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Nudt8Q9CR24 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Nudt8Q9CR24 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Nudt8Q9CR24 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Nudt8Q9CR24 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Nudt8Q9CR24 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Nudt8Q9CR24 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Nudt8Q9CR24 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nudt8Q9CR24 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Nudt8Q9CR24 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nudt8Q9CR24 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nudt8Q9CR24 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nudt8Q9CR24 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nudt8Q9CR24 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Nudt8Q9CR24 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Nudt8Q9CR24 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nudt8Q9CR24 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nudt8Q9CR24 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nudt8Q9CR24 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nudt8Q9CR24 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nudt8Q9CR24 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nudt8Q9CR24 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nudt8Q9CR24 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nudt8Q9CR24 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nudt8Q9CR24 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nudt8Q9CR24 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Nudt8Q9CR24 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nudt8Q9CR24 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nudt8Q9CR24 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nudt8Q9CR24 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Nudt8Q9CR24 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Nudt8Q9CR24 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Nudt8Q9CR24 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Nudt8Q9CR24 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nudt8Q9CR24 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Nudt8Q9CR24 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Nudt8Q9CR24 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nudt8Q9CR24 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nudt8Q9CR24 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nudt8Q9CR24 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Nudt8Q9CR24 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nudt8Q9CR24 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nudt8Q9CR24 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nudt8Q9CR24 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nudt8Q9CR24 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Nudt8Q9CR24 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nudt8Q9CR24 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nudt8Q9CR24 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nudt8Q9CR24 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nudt8Q9CR24 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nudt8Q9CR24 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nudt8Q9CR24 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nudt8Q9CR24 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nudt8Q9CR24 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Nudt8Q9CR24 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Nudt8Q9CR24 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nudt8Q9CR24 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nudt8Q9CR24 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Nudt8Q9CR24 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nudt8Q9CR24 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nudt8Q9CR24 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nudt8Q9CR24 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nudt8Q9CR24 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nudt8Q9CR24 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nudt8Q9CR24 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nudt8Q9CR24 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Nudt8Q9CR24 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nudt8Q9CR24 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nudt8Q9CR24 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nudt8Q9CR24 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nudt8Q9CR24 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nudt8Q9CR24 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nudt8Q9CR24 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nudt8Q9CR24 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nudt8Q9CR24 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Nudt8Q9CR24 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nudt8Q9CR24 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Nudt8Q9CR24 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nudt8Q9CR24 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Nudt8Q9CR24 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Nudt8Q9CR24 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nudt8Q9CR24 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nudt8Q9CR24 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nudt8Q9CR24 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nudt8Q9CR24 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nudt8Q9CR24 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nudt8Q9CR24 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nudt8Q9CR24 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nudt8Q9CR24 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nudt8Q9CR24 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nudt8Q9CR24 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nudt8Q9CR24 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms