Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TpbpbQ9CQC0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TpbpbQ9CQC0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TpbpbQ9CQC0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TpbpbQ9CQC0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TpbpbQ9CQC0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TpbpbQ9CQC0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TpbpbQ9CQC0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TpbpbQ9CQC0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TpbpbQ9CQC0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TpbpbQ9CQC0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TpbpbQ9CQC0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TpbpbQ9CQC0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TpbpbQ9CQC0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TpbpbQ9CQC0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TpbpbQ9CQC0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TpbpbQ9CQC0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TpbpbQ9CQC0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TpbpbQ9CQC0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TpbpbQ9CQC0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TpbpbQ9CQC0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TpbpbQ9CQC0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TpbpbQ9CQC0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TpbpbQ9CQC0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TpbpbQ9CQC0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TpbpbQ9CQC0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TpbpbQ9CQC0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TpbpbQ9CQC0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TpbpbQ9CQC0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TpbpbQ9CQC0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TpbpbQ9CQC0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TpbpbQ9CQC0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TpbpbQ9CQC0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TpbpbQ9CQC0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TpbpbQ9CQC0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TpbpbQ9CQC0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TpbpbQ9CQC0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TpbpbQ9CQC0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TpbpbQ9CQC0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TpbpbQ9CQC0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TpbpbQ9CQC0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TpbpbQ9CQC0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TpbpbQ9CQC0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TpbpbQ9CQC0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TpbpbQ9CQC0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TpbpbQ9CQC0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TpbpbQ9CQC0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TpbpbQ9CQC0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TpbpbQ9CQC0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TpbpbQ9CQC0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TpbpbQ9CQC0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TpbpbQ9CQC0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TpbpbQ9CQC0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TpbpbQ9CQC0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TpbpbQ9CQC0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TpbpbQ9CQC0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TpbpbQ9CQC0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TpbpbQ9CQC0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TpbpbQ9CQC0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TpbpbQ9CQC0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TpbpbQ9CQC0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TpbpbQ9CQC0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TpbpbQ9CQC0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TpbpbQ9CQC0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TpbpbQ9CQC0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TpbpbQ9CQC0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TpbpbQ9CQC0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TpbpbQ9CQC0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TpbpbQ9CQC0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TpbpbQ9CQC0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TpbpbQ9CQC0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TpbpbQ9CQC0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TpbpbQ9CQC0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TpbpbQ9CQC0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TpbpbQ9CQC0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TpbpbQ9CQC0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TpbpbQ9CQC0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TpbpbQ9CQC0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TpbpbQ9CQC0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TpbpbQ9CQC0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TpbpbQ9CQC0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TpbpbQ9CQC0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TpbpbQ9CQC0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TpbpbQ9CQC0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TpbpbQ9CQC0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TpbpbQ9CQC0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TpbpbQ9CQC0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TpbpbQ9CQC0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TpbpbQ9CQC0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TpbpbQ9CQC0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TpbpbQ9CQC0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TpbpbQ9CQC0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TpbpbQ9CQC0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TpbpbQ9CQC0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TpbpbQ9CQC0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TpbpbQ9CQC0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TpbpbQ9CQC0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TpbpbQ9CQC0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TpbpbQ9CQC0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TpbpbQ9CQC0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms