Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GBP4Q96PP9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GBP4Q96PP9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GBP4Q96PP9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GBP4Q96PP9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GBP4Q96PP9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GBP4Q96PP9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GBP4Q96PP9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GBP4Q96PP9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GBP4Q96PP9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.81■■■■□ 3
GBP4Q96PP9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
GBP4Q96PP9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GBP4Q96PP9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GBP4Q96PP9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GBP4Q96PP9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GBP4Q96PP9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GBP4Q96PP9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GBP4Q96PP9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GBP4Q96PP9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GBP4Q96PP9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GBP4Q96PP9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GBP4Q96PP9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GBP4Q96PP9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GBP4Q96PP9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GBP4Q96PP9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GBP4Q96PP9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
GBP4Q96PP9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GBP4Q96PP9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GBP4Q96PP9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GBP4Q96PP9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
GBP4Q96PP9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GBP4Q96PP9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GBP4Q96PP9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GBP4Q96PP9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GBP4Q96PP9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GBP4Q96PP9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GBP4Q96PP9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GBP4Q96PP9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GBP4Q96PP9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GBP4Q96PP9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GBP4Q96PP9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GBP4Q96PP9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GBP4Q96PP9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GBP4Q96PP9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GBP4Q96PP9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GBP4Q96PP9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GBP4Q96PP9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GBP4Q96PP9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GBP4Q96PP9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GBP4Q96PP9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
GBP4Q96PP9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GBP4Q96PP9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GBP4Q96PP9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GBP4Q96PP9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GBP4Q96PP9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GBP4Q96PP9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GBP4Q96PP9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GBP4Q96PP9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GBP4Q96PP9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GBP4Q96PP9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GBP4Q96PP9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GBP4Q96PP9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GBP4Q96PP9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GBP4Q96PP9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GBP4Q96PP9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GBP4Q96PP9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GBP4Q96PP9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GBP4Q96PP9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GBP4Q96PP9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GBP4Q96PP9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GBP4Q96PP9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
GBP4Q96PP9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
GBP4Q96PP9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GBP4Q96PP9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GBP4Q96PP9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
GBP4Q96PP9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GBP4Q96PP9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GBP4Q96PP9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GBP4Q96PP9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GBP4Q96PP9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GBP4Q96PP9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GBP4Q96PP9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GBP4Q96PP9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GBP4Q96PP9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GBP4Q96PP9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
GBP4Q96PP9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
GBP4Q96PP9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GBP4Q96PP9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GBP4Q96PP9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GBP4Q96PP9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GBP4Q96PP9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GBP4Q96PP9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
GBP4Q96PP9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GBP4Q96PP9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
GBP4Q96PP9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GBP4Q96PP9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GBP4Q96PP9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GBP4Q96PP9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GBP4Q96PP9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GBP4Q96PP9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms