Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
LRRC7Q96NW7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42.44■■■■■ 4.38
LRRC7Q96NW7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
LRRC7Q96NW7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
LRRC7Q96NW7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
LRRC7Q96NW7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
LRRC7Q96NW7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
LRRC7Q96NW7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
LRRC7Q96NW7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
LRRC7Q96NW7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
LRRC7Q96NW7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
LRRC7Q96NW7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
LRRC7Q96NW7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
LRRC7Q96NW7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
LRRC7Q96NW7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
LRRC7Q96NW7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
LRRC7Q96NW7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
LRRC7Q96NW7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC41.97■■■■■ 4.31
LRRC7Q96NW7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
LRRC7Q96NW7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
LRRC7Q96NW7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
LRRC7Q96NW7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
LRRC7Q96NW7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
LRRC7Q96NW7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
LRRC7Q96NW7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
LRRC7Q96NW7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
LRRC7Q96NW7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
LRRC7Q96NW7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
LRRC7Q96NW7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
LRRC7Q96NW7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
LRRC7Q96NW7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
LRRC7Q96NW7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
LRRC7Q96NW7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
LRRC7Q96NW7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
LRRC7Q96NW7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
LRRC7Q96NW7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
LRRC7Q96NW7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
LRRC7Q96NW7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
LRRC7Q96NW7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
LRRC7Q96NW7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
LRRC7Q96NW7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.47■■■■■ 4.23
LRRC7Q96NW7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
LRRC7Q96NW7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
LRRC7Q96NW7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.44■■■■■ 4.23
LRRC7Q96NW7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
LRRC7Q96NW7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
LRRC7Q96NW7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
LRRC7Q96NW7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
LRRC7Q96NW7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
LRRC7Q96NW7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
LRRC7Q96NW7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
LRRC7Q96NW7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
LRRC7Q96NW7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
LRRC7Q96NW7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
LRRC7Q96NW7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
LRRC7Q96NW7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
LRRC7Q96NW7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
LRRC7Q96NW7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
LRRC7Q96NW7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
LRRC7Q96NW7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
LRRC7Q96NW7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
LRRC7Q96NW7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
LRRC7Q96NW7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
LRRC7Q96NW7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
LRRC7Q96NW7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
LRRC7Q96NW7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
LRRC7Q96NW7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
LRRC7Q96NW7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
LRRC7Q96NW7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
LRRC7Q96NW7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
LRRC7Q96NW7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
LRRC7Q96NW7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
LRRC7Q96NW7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
LRRC7Q96NW7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
LRRC7Q96NW7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
LRRC7Q96NW7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC40.88■■■■■ 4.13
LRRC7Q96NW7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
LRRC7Q96NW7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
LRRC7Q96NW7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
LRRC7Q96NW7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
LRRC7Q96NW7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
LRRC7Q96NW7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
LRRC7Q96NW7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
LRRC7Q96NW7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
LRRC7Q96NW7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
LRRC7Q96NW7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
LRRC7Q96NW7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
LRRC7Q96NW7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
LRRC7Q96NW7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
LRRC7Q96NW7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
LRRC7Q96NW7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
LRRC7Q96NW7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
LRRC7Q96NW7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
LRRC7Q96NW7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
LRRC7Q96NW7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
LRRC7Q96NW7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
LRRC7Q96NW7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
LRRC7Q96NW7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
LRRC7Q96NW7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
LRRC7Q96NW7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms