Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Nlrp6Q91WS2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Nlrp6Q91WS2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Nlrp6Q91WS2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Nlrp6Q91WS2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Nlrp6Q91WS2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Nlrp6Q91WS2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Nlrp6Q91WS2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Nlrp6Q91WS2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Nlrp6Q91WS2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Nlrp6Q91WS2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Nlrp6Q91WS2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Nlrp6Q91WS2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Nlrp6Q91WS2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Nlrp6Q91WS2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Nlrp6Q91WS2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Nlrp6Q91WS2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Nlrp6Q91WS2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Nlrp6Q91WS2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Nlrp6Q91WS2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Nlrp6Q91WS2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Nlrp6Q91WS2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Nlrp6Q91WS2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Nlrp6Q91WS2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Nlrp6Q91WS2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Nlrp6Q91WS2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Nlrp6Q91WS2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Nlrp6Q91WS2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Nlrp6Q91WS2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Nlrp6Q91WS2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Nlrp6Q91WS2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Nlrp6Q91WS2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Nlrp6Q91WS2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Nlrp6Q91WS2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Nlrp6Q91WS2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Nlrp6Q91WS2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Nlrp6Q91WS2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Nlrp6Q91WS2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Nlrp6Q91WS2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Nlrp6Q91WS2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Nlrp6Q91WS2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Nlrp6Q91WS2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Nlrp6Q91WS2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Nlrp6Q91WS2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Nlrp6Q91WS2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Nlrp6Q91WS2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Nlrp6Q91WS2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Nlrp6Q91WS2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Nlrp6Q91WS2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Nlrp6Q91WS2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Nlrp6Q91WS2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Nlrp6Q91WS2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Nlrp6Q91WS2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Nlrp6Q91WS2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Nlrp6Q91WS2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Nlrp6Q91WS2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Nlrp6Q91WS2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Nlrp6Q91WS2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Nlrp6Q91WS2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Nlrp6Q91WS2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Nlrp6Q91WS2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Nlrp6Q91WS2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Nlrp6Q91WS2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Nlrp6Q91WS2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Nlrp6Q91WS2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Nlrp6Q91WS2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Nlrp6Q91WS2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Nlrp6Q91WS2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Nlrp6Q91WS2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Nlrp6Q91WS2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Nlrp6Q91WS2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Nlrp6Q91WS2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Nlrp6Q91WS2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Nlrp6Q91WS2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Nlrp6Q91WS2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Nlrp6Q91WS2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Nlrp6Q91WS2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Nlrp6Q91WS2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Nlrp6Q91WS2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Nlrp6Q91WS2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Nlrp6Q91WS2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Nlrp6Q91WS2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Nlrp6Q91WS2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Nlrp6Q91WS2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Nlrp6Q91WS2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Nlrp6Q91WS2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Nlrp6Q91WS2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Nlrp6Q91WS2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Nlrp6Q91WS2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Nlrp6Q91WS2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Nlrp6Q91WS2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Nlrp6Q91WS2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Nlrp6Q91WS2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Nlrp6Q91WS2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Nlrp6Q91WS2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Nlrp6Q91WS2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Nlrp6Q91WS2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Nlrp6Q91WS2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Nlrp6Q91WS2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Nlrp6Q91WS2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.8 ms