Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWS0

PHF6, PHD finger protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF6Q8IWS0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.059e-9■■■■■ 52.5
PHF6Q8IWS0 AP001347.1-203ENST00000448463 780 ntTSL 214.48□□□□□ -0.099e-9■■■■■ 52.5
PHF6Q8IWS0 TSC2-206ENST00000439117 5073 ntTSL 1 (best)14.14□□□□□ -0.159e-9■■■■■ 52.5
PHF6Q8IWS0 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.159e-9■■■■■ 52.5
PHF6Q8IWS0 TSC2-216ENST00000497886 3248 ntTSL 213□□□□□ -0.339e-9■■■■■ 52.5
PHF6Q8IWS0 AP001347.1-201ENST00000428809 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.929e-9■■■■■ 52.5
PHF6Q8IWS0 AP001347.1-202ENST00000432621 1084 ntTSL 1 (best)8.74□□□□□ -1.019e-9■■■■■ 52.5
PHF6Q8IWS0 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.074e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-222ENST00000451607 1007 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.574e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-203ENST00000416952 799 ntTSL 211.36□□□□□ -0.594e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-216ENST00000443799 897 ntTSL 510.74□□□□□ -0.694e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 310.74□□□□□ -0.694e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-224ENST00000454068 688 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.774e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-210ENST00000431268 1698 ntTSL 29.65□□□□□ -0.864e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-226ENST00000455838 632 ntTSL 29.15□□□□□ -0.944e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.944e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-220ENST00000449589 712 ntTSL 39.15□□□□□ -0.944e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.994e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-227ENST00000456293 583 ntTSL 37.89□□□□□ -1.154e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 37.47□□□□□ -1.214e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-204ENST00000421068 1060 ntTSL 26.97□□□□□ -1.294e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-229ENST00000458220 469 ntTSL 26.66□□□□□ -1.344e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.344e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 56.36□□□□□ -1.394e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 26.05□□□□□ -1.444e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-215ENST00000442067 1114 ntTSL 25.79□□□□□ -1.484e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.524e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.594e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 34.64□□□□□ -1.674e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.714e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 23.48□□□□□ -1.854e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.861e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 PHKB-207ENST00000566037 1032 ntTSL 226.61■■□□□ 1.851e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.441e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 TRAF4-215ENST00000584944 825 ntTSL 215.48■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 PHKB-203ENST00000563376 697 ntTSL 315.21■□□□□ 0.031e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 PHKB-202ENST00000323584 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 SRP14-AS1-201ENST00000504245 2317 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 PHKB-217ENST00000570047 797 ntTSL 310.25□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 PHKB-214ENST00000567402 1617 ntTSL 1 (best)10.02□□□□□ -0.811e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.871e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 PHKB-206ENST00000565424 828 ntTSL 36.81□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.33e-7■■■■■ 50.9
PHF6Q8IWS0 ASMTL-AS1-202ENST00000420411 697 ntTSL 1 (best)11.48□□□□□ -0.573e-7■■■■■ 50.9
PHF6Q8IWS0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.194e-8■■■■■ 50.6
PHF6Q8IWS0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.112e-6■■■■■ 50.5
PHF6Q8IWS0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.112e-6■■■■■ 50.5
PHF6Q8IWS0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 50.5
PHF6Q8IWS0 PXMP2-202ENST00000428960 762 ntTSL 320.41■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 50.5
PHF6Q8IWS0 PXMP2-204ENST00000539093 516 ntTSL 319.33■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 50.5
PHF6Q8IWS0 FOXK2-211ENST00000575578 571 ntTSL 216.03■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 48.9
PHF6Q8IWS0 MAEA-212ENST00000509531 1001 ntTSL 1 (best)21.62■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 SPPL2B-201ENST00000585725 583 ntTSL 318.96■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 MAEA-203ENST00000502558 570 ntTSL 218.46■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 MAEA-205ENST00000503653 845 ntTSL 316■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.054e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.54e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GRB10-212ENST00000439044 733 ntTSL 523.53■■□□□ 1.364e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.154e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.014e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.974e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 AHNAK-207ENST00000531324 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.43■□□□□ 0.864e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 AHNAK-208ENST00000533365 584 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.23■□□□□ 0.834e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.824e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.754e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.654e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.534e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.344e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.294e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GNB2-210ENST00000451587 887 ntTSL 516.64■□□□□ 0.254e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.124e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 AHNAK-204ENST00000528508 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 415.78■□□□□ 0.124e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 ZNF518B-205ENST00000515072 2623 ntTSL 1 (best)15.24■□□□□ 0.034e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 AHNAK-206ENST00000530285 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.85□□□□□ -0.034e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.144e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 ZNF518B-204ENST00000507515 527 ntTSL 414.11□□□□□ -0.154e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 ZNF518B-203ENST00000503068 4196 ntTSL 1 (best)10.51□□□□□ -0.734e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 ZNF518B-202ENST00000500268 4145 ntTSL 1 (best)7.9□□□□□ -1.144e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.554e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.624e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.194e-7■■■■■ 48.2
PHF6Q8IWS0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 48.2
PHF6Q8IWS0 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 48.2
PHF6Q8IWS0 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 48.2
PHF6Q8IWS0 APBA2-204ENST00000558259 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.654e-7■■■■■ 48.2
PHF6Q8IWS0 MVD-204ENST00000562741 217 ntTSL 225.29■■□□□ 1.644e-6■■■■■ 46.4
PHF6Q8IWS0 MVD-210ENST00000565610 507 ntTSL 322.37■■□□□ 1.174e-6■■■■■ 46.4
PHF6Q8IWS0 MVD-214ENST00000567064 758 ntTSL 320.5■□□□□ 0.874e-6■■■■■ 46.4
PHF6Q8IWS0 MVD-208ENST00000563785 888 ntTSL 219.57■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 46.4
PHF6Q8IWS0 MVD-207ENST00000563463 543 ntTSL 319.52■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 46.4
PHF6Q8IWS0 MVD-217ENST00000569177 870 ntTSL 519.45■□□□□ 0.74e-6■■■■■ 46.4
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