Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0W1

Ankmy1, Ankyrin repeat and MYND domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankmy1Q8C0W1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Ankmy1Q8C0W1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ankmy1Q8C0W1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ankmy1Q8C0W1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Ankmy1Q8C0W1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Ankmy1Q8C0W1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ankmy1Q8C0W1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Ankmy1Q8C0W1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Ankmy1Q8C0W1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ankmy1Q8C0W1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ankmy1Q8C0W1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ankmy1Q8C0W1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ankmy1Q8C0W1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ankmy1Q8C0W1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ankmy1Q8C0W1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ankmy1Q8C0W1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Ankmy1Q8C0W1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Ankmy1Q8C0W1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ankmy1Q8C0W1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ankmy1Q8C0W1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ankmy1Q8C0W1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ankmy1Q8C0W1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ankmy1Q8C0W1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ankmy1Q8C0W1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ankmy1Q8C0W1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ankmy1Q8C0W1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ankmy1Q8C0W1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ankmy1Q8C0W1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ankmy1Q8C0W1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ankmy1Q8C0W1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ankmy1Q8C0W1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Ankmy1Q8C0W1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ankmy1Q8C0W1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ankmy1Q8C0W1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ankmy1Q8C0W1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ankmy1Q8C0W1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ankmy1Q8C0W1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ankmy1Q8C0W1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ankmy1Q8C0W1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ankmy1Q8C0W1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ankmy1Q8C0W1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ankmy1Q8C0W1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ankmy1Q8C0W1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ankmy1Q8C0W1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ankmy1Q8C0W1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ankmy1Q8C0W1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ankmy1Q8C0W1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ankmy1Q8C0W1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ankmy1Q8C0W1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ankmy1Q8C0W1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ankmy1Q8C0W1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ankmy1Q8C0W1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ankmy1Q8C0W1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ankmy1Q8C0W1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ankmy1Q8C0W1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ankmy1Q8C0W1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ankmy1Q8C0W1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ankmy1Q8C0W1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ankmy1Q8C0W1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ankmy1Q8C0W1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ankmy1Q8C0W1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ankmy1Q8C0W1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ankmy1Q8C0W1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ankmy1Q8C0W1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ankmy1Q8C0W1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ankmy1Q8C0W1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ankmy1Q8C0W1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ankmy1Q8C0W1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ankmy1Q8C0W1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ankmy1Q8C0W1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ankmy1Q8C0W1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ankmy1Q8C0W1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ankmy1Q8C0W1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ankmy1Q8C0W1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ankmy1Q8C0W1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ankmy1Q8C0W1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ankmy1Q8C0W1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ankmy1Q8C0W1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ankmy1Q8C0W1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ankmy1Q8C0W1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ankmy1Q8C0W1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ankmy1Q8C0W1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ankmy1Q8C0W1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ankmy1Q8C0W1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ankmy1Q8C0W1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankmy1Q8C0W1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankmy1Q8C0W1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ankmy1Q8C0W1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ankmy1Q8C0W1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ankmy1Q8C0W1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ankmy1Q8C0W1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ankmy1Q8C0W1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ankmy1Q8C0W1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ankmy1Q8C0W1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ankmy1Q8C0W1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankmy1Q8C0W1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ankmy1Q8C0W1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ankmy1Q8C0W1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ankmy1Q8C0W1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ankmy1Q8C0W1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.4 ms