Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Trmt12Q8BG71 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Trmt12Q8BG71 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Trmt12Q8BG71 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Trmt12Q8BG71 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Trmt12Q8BG71 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Trmt12Q8BG71 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Trmt12Q8BG71 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Trmt12Q8BG71 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Trmt12Q8BG71 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Trmt12Q8BG71 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Trmt12Q8BG71 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Trmt12Q8BG71 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Trmt12Q8BG71 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trmt12Q8BG71 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Trmt12Q8BG71 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Trmt12Q8BG71 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Trmt12Q8BG71 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Trmt12Q8BG71 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Trmt12Q8BG71 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Trmt12Q8BG71 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Trmt12Q8BG71 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trmt12Q8BG71 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trmt12Q8BG71 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trmt12Q8BG71 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trmt12Q8BG71 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trmt12Q8BG71 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trmt12Q8BG71 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trmt12Q8BG71 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Trmt12Q8BG71 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trmt12Q8BG71 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Trmt12Q8BG71 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trmt12Q8BG71 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trmt12Q8BG71 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Trmt12Q8BG71 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trmt12Q8BG71 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trmt12Q8BG71 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trmt12Q8BG71 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trmt12Q8BG71 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trmt12Q8BG71 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trmt12Q8BG71 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trmt12Q8BG71 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trmt12Q8BG71 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trmt12Q8BG71 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trmt12Q8BG71 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trmt12Q8BG71 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trmt12Q8BG71 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Trmt12Q8BG71 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trmt12Q8BG71 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trmt12Q8BG71 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trmt12Q8BG71 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trmt12Q8BG71 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trmt12Q8BG71 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trmt12Q8BG71 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trmt12Q8BG71 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trmt12Q8BG71 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trmt12Q8BG71 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trmt12Q8BG71 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Trmt12Q8BG71 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trmt12Q8BG71 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trmt12Q8BG71 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trmt12Q8BG71 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Trmt12Q8BG71 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trmt12Q8BG71 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trmt12Q8BG71 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trmt12Q8BG71 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trmt12Q8BG71 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trmt12Q8BG71 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trmt12Q8BG71 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trmt12Q8BG71 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trmt12Q8BG71 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trmt12Q8BG71 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trmt12Q8BG71 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trmt12Q8BG71 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Trmt12Q8BG71 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trmt12Q8BG71 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trmt12Q8BG71 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trmt12Q8BG71 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trmt12Q8BG71 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trmt12Q8BG71 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trmt12Q8BG71 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trmt12Q8BG71 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trmt12Q8BG71 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trmt12Q8BG71 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Trmt12Q8BG71 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trmt12Q8BG71 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trmt12Q8BG71 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trmt12Q8BG71 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Trmt12Q8BG71 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trmt12Q8BG71 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Trmt12Q8BG71 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Trmt12Q8BG71 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trmt12Q8BG71 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trmt12Q8BG71 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trmt12Q8BG71 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trmt12Q8BG71 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trmt12Q8BG71 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trmt12Q8BG71 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Trmt12Q8BG71 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trmt12Q8BG71 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms