Protein–RNA interactions for Protein: Q86U42

PABPN1, Polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1Q86U42 GOLGA8B-209ENST00000568555 2328 ntTSL 1 (best)23.59■■□□□ 1.372e-7■■■■■ 38.2
PABPN1Q86U42 CHTF18-213ENST00000498439 673 ntTSL 237.91■■■■□ 3.667e-7■■■■■ 38
PABPN1Q86U42 TMEM161A-204ENST00000587096 1065 ntTSL 537.21■■■■□ 3.552e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 HGS-212ENST00000575058 632 ntTSL 333.85■■■■□ 3.012e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 HGS-207ENST00000571885 350 ntTSL 333.66■■■□□ 2.982e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 TMEM161A-209ENST00000587985 1754 ntTSL 533.02■■■□□ 2.882e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 TMEM161A-208ENST00000587925 582 ntTSL 332.32■■■□□ 2.762e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.682e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.652e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 TMEM161A-210ENST00000589448 1799 ntTSL 531.16■■■□□ 2.582e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 TMEM161A-205ENST00000587406 1923 ntTSL 530.8■■■□□ 2.522e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.392e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.123e-8■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 RAC3-204ENST00000585014 798 ntTSL 236.8■■■■□ 3.483e-8■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 EMD-205ENST00000471965 800 ntTSL 242.1■■■■■ 4.331e-18■■■■■ 37.4
PABPN1Q86U42 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.61e-18■■■■■ 37.4
PABPN1Q86U42 EMD-203ENST00000428228 946 ntTSL 335.89■■■■□ 3.341e-18■■■■■ 37.4
PABPN1Q86U42 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.31e-18■■■■■ 37.4
PABPN1Q86U42 EMD-208ENST00000492448 832 ntTSL 231.11■■■□□ 2.571e-18■■■■■ 37.4
PABPN1Q86U42 MHENCR-201ENST00000411579 582 ntTSL 241.78■■■■■ 4.281e-6■■■■■ 36.9
PABPN1Q86U42 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.431e-6■■■■■ 36.9
PABPN1Q86U42 LTB4R-205ENST00000556141 797 ntTSL 345.53■■■■■ 4.887e-10■■■■■ 36.7
PABPN1Q86U42 ACADVL-220ENST00000579546 582 ntTSL 537.27■■■■□ 3.566e-9■■■■■ 36.7
PABPN1Q86U42 NCAPH2-209ENST00000522304 521 ntTSL 335.04■■■■□ 3.23e-8■■■■■ 36.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-239ENST00000585203 947 ntTSL 530.77■■■□□ 2.527e-9■■■■■ 36.4
PABPN1Q86U42 KAT2A-205ENST00000592310 596 ntTSL 317.51■□□□□ 0.391e-14■■■■■ 35.9
PABPN1Q86U42 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.29■■■■■ 5.481e-6■■■■■ 35.7
PABPN1Q86U42 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC48.39■■■■■ 5.341e-6■■■■■ 35.7
PABPN1Q86U42 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.711e-6■■■■■ 35.7
PABPN1Q86U42 COL7A1-205ENST00000465238 587 ntTSL 236.31■■■■□ 3.41e-6■■■■■ 35.6
PABPN1Q86U42 COL7A1-208ENST00000470076 651 ntTSL 236.31■■■■□ 3.41e-6■■■■■ 35.6
PABPN1Q86U42 ACADVL-209ENST00000578033 562 ntTSL 234.33■■■■□ 3.094e-18■■■■■ 35.5
PABPN1Q86U42 REC8-205ENST00000559939 494 ntTSL 223.44■■□□□ 1.341e-7■■■■■ 35.4
PABPN1Q86U42 HGS-203ENST00000570652 523 ntTSL 538.14■■■■□ 3.76e-11■■■■■ 35.3
PABPN1Q86U42 RCN3-202ENST00000593483 595 ntTSL 532.24■■■□□ 2.752e-7■■■■■ 35.3
PABPN1Q86U42 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.55■■■■■ 5.364e-7■■■■■ 35.2
PABPN1Q86U42 CENPX-203ENST00000577379 861 ntTSL 545.35■■■■■ 4.854e-7■■■■■ 35.2
PABPN1Q86U42 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.824e-7■■■■■ 35.2
PABPN1Q86U42 CENPX-207ENST00000583767 894 ntTSL 338.37■■■■□ 3.734e-7■■■■■ 35.2
PABPN1Q86U42 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.624e-7■■■■■ 35.2
PABPN1Q86U42 CENPX-209ENST00000584514 882 ntTSL 237.59■■■■□ 3.614e-7■■■■■ 35.2
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PABPN1Q86U42 CENPX-204ENST00000579520 702 ntTSL 333.95■■■■□ 3.034e-7■■■■■ 35.2
PABPN1Q86U42 CENPX-210ENST00000584600 730 ntTSL 232.98■■■□□ 2.874e-7■■■■■ 35.2
PABPN1Q86U42 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.34e-7■■■■■ 35.2
PABPN1Q86U42 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.62e-11■■■■■ 35.1
PABPN1Q86U42 ACADVL-236ENST00000583850 903 ntTSL 233.29■■■□□ 2.925e-9■■■■■ 35
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PABPN1Q86U42 NINL-205ENST00000464285 1514 ntTSL 230.25■■■□□ 2.433e-8■■■■■ 34.7
PABPN1Q86U42 ACY1-202ENST00000464587 538 ntTSL 333.14■■■□□ 2.96e-7■■■■■ 34.5
PABPN1Q86U42 ACY1-228ENST00000638096 1466 nt30.83■■■□□ 2.536e-7■■■■■ 34.5
PABPN1Q86U42 IRF3-211ENST00000596644 550 ntTSL 229.41■■■□□ 2.33e-9■■■■■ 34.5
PABPN1Q86U42 IRF3-224ENST00000599680 472 ntTSL 328.93■■■□□ 2.223e-9■■■■■ 34.5
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PABPN1Q86U42 ACADVL-204ENST00000542255 1016 ntTSL 533.68■■■□□ 2.985e-9■■■■■ 34.2
PABPN1Q86U42 ACADVL-219ENST00000579425 1234 ntTSL 530.77■■■□□ 2.525e-9■■■■■ 34.2
PABPN1Q86U42 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.075e-9■■■■■ 34.2
PABPN1Q86U42 ACADVL-201ENST00000322910 2352 ntTSL 232.98■■■□□ 2.875e-9■■■■■ 34.2
PABPN1Q86U42 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.845e-9■■■■■ 34.2
PABPN1Q86U42 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.685e-9■■■■■ 34.2
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PABPN1Q86U42 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.552e-8■■■■■ 33.9
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PABPN1Q86U42 WDR90-225ENST00000553080 1941 ntTSL 227.53■■■□□ 22e-8■■■■■ 33.9
PABPN1Q86U42 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.52e-8■■■■■ 33.9
PABPN1Q86U42 WDR90-223ENST00000552728 3133 ntTSL 523.08■■□□□ 1.282e-8■■■■■ 33.9
PABPN1Q86U42 WDR90-207ENST00000547407 3847 ntTSL 218.98■□□□□ 0.632e-8■■■■■ 33.9
PABPN1Q86U42 FTCD-209ENST00000483568 398 ntTSL 520.56■□□□□ 0.883e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-226ENST00000581562 571 ntTSL 346.55■■■■■ 5.041e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-217ENST00000579286 933 ntTSL 345.68■■■■■ 4.91e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-233ENST00000583312 799 ntTSL 345.68■■■■■ 4.91e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-208ENST00000577857 566 ntTSL 445.68■■■■■ 4.91e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-238ENST00000584103 555 ntTSL 444■■■■■ 4.631e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-221ENST00000579886 502 ntTSL 541.01■■■■■ 4.161e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-227ENST00000582056 738 ntTSL 240.04■■■■■ 41e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-206ENST00000577191 1212 ntTSL 239.45■■■■□ 3.911e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.385e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-207ENST00000577433 803 ntTSL 234.05■■■■□ 3.041e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-221ENST00000527540 367 ntTSL 232.5■■■□□ 2.795e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-243ENST00000532162 769 ntTSL 228.35■■■□□ 2.135e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-258ENST00000534278 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.575e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-228ENST00000582166 550 ntTSL 424.37■■□□□ 1.491e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-230ENST00000530438 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.035e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-207ENST00000526099 2404 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.985e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.875e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.865e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-202ENST00000524513 602 ntTSL 216.23■□□□□ 0.195e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-213ENST00000526757 3019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.145e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-237ENST00000530991 3396 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.285e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC11.09□□□□□ -0.634e-21■■■■■ 33.1
PABPN1Q86U42 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.267e-7■■■■■ 33
PABPN1Q86U42 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.867e-7■■■■■ 33
PABPN1Q86U42 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.637e-7■■■■■ 33
PABPN1Q86U42 CHTF18-207ENST00000464728 4088 ntTSL 223.68■■□□□ 1.387e-7■■■■■ 33
PABPN1Q86U42 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.367e-7■■■■■ 33
PABPN1Q86U42 CHTF18-208ENST00000471202 4494 ntTSL 221.26■□□□□ 0.997e-7■■■■■ 33
PABPN1Q86U42 CHTF18-204ENST00000440239 1801 ntTSL 1 (best)44.29■■■■■ 4.681e-6■■■■■ 32.8
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