Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Rpap1Q80TE0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Rpap1Q80TE0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC42.63■■■■■ 4.42
Rpap1Q80TE0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Rpap1Q80TE0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Rpap1Q80TE0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
Rpap1Q80TE0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Rpap1Q80TE0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Rpap1Q80TE0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
Rpap1Q80TE0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
Rpap1Q80TE0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
Rpap1Q80TE0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Rpap1Q80TE0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Rpap1Q80TE0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
Rpap1Q80TE0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
Rpap1Q80TE0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
Rpap1Q80TE0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Rpap1Q80TE0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Rpap1Q80TE0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC42.32■■■■■ 4.36
Rpap1Q80TE0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Rpap1Q80TE0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Rpap1Q80TE0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
Rpap1Q80TE0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Rpap1Q80TE0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Rpap1Q80TE0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Rpap1Q80TE0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
Rpap1Q80TE0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Rpap1Q80TE0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
Rpap1Q80TE0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Rpap1Q80TE0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Rpap1Q80TE0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Rpap1Q80TE0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
Rpap1Q80TE0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
Rpap1Q80TE0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Rpap1Q80TE0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Rpap1Q80TE0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Rpap1Q80TE0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Rpap1Q80TE0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Rpap1Q80TE0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Rpap1Q80TE0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Rpap1Q80TE0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Rpap1Q80TE0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Rpap1Q80TE0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
Rpap1Q80TE0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Rpap1Q80TE0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Rpap1Q80TE0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Rpap1Q80TE0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Rpap1Q80TE0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Rpap1Q80TE0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Rpap1Q80TE0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Rpap1Q80TE0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Rpap1Q80TE0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Rpap1Q80TE0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Rpap1Q80TE0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Rpap1Q80TE0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Rpap1Q80TE0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Rpap1Q80TE0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Rpap1Q80TE0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Rpap1Q80TE0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Rpap1Q80TE0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Rpap1Q80TE0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Rpap1Q80TE0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Rpap1Q80TE0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Rpap1Q80TE0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
Rpap1Q80TE0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
Rpap1Q80TE0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.26
Rpap1Q80TE0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
Rpap1Q80TE0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Rpap1Q80TE0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Rpap1Q80TE0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Rpap1Q80TE0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
Rpap1Q80TE0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Rpap1Q80TE0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Rpap1Q80TE0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Rpap1Q80TE0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
Rpap1Q80TE0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Rpap1Q80TE0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Rpap1Q80TE0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
Rpap1Q80TE0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Rpap1Q80TE0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Rpap1Q80TE0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Rpap1Q80TE0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Rpap1Q80TE0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rpap1Q80TE0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rpap1Q80TE0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rpap1Q80TE0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Rpap1Q80TE0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Rpap1Q80TE0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
Rpap1Q80TE0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
Rpap1Q80TE0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Rpap1Q80TE0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Rpap1Q80TE0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Rpap1Q80TE0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Rpap1Q80TE0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Rpap1Q80TE0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Rpap1Q80TE0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Rpap1Q80TE0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Rpap1Q80TE0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Rpap1Q80TE0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Rpap1Q80TE0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms