Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
SynmQ70IV5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC45.89■■■■■ 4.94
SynmQ70IV5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
SynmQ70IV5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC45.84■■■■■ 4.93
SynmQ70IV5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
SynmQ70IV5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
SynmQ70IV5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
SynmQ70IV5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
SynmQ70IV5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
SynmQ70IV5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
SynmQ70IV5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
SynmQ70IV5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
SynmQ70IV5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
SynmQ70IV5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC45.38■■■■■ 4.85
SynmQ70IV5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
SynmQ70IV5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC45.31■■■■■ 4.84
SynmQ70IV5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
SynmQ70IV5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
SynmQ70IV5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
SynmQ70IV5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC45.22■■■■■ 4.83
SynmQ70IV5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
SynmQ70IV5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
SynmQ70IV5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC45.14■■■■■ 4.82
SynmQ70IV5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
SynmQ70IV5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
SynmQ70IV5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
SynmQ70IV5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
SynmQ70IV5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
SynmQ70IV5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
SynmQ70IV5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC44.98■■■■■ 4.79
SynmQ70IV5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC44.96■■■■■ 4.79
SynmQ70IV5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
SynmQ70IV5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
SynmQ70IV5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
SynmQ70IV5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
SynmQ70IV5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
SynmQ70IV5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
SynmQ70IV5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
SynmQ70IV5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
SynmQ70IV5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
SynmQ70IV5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
SynmQ70IV5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
SynmQ70IV5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
SynmQ70IV5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
SynmQ70IV5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC44.62■■■■■ 4.73
SynmQ70IV5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
SynmQ70IV5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
SynmQ70IV5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
SynmQ70IV5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
SynmQ70IV5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC44.54■■■■■ 4.72
SynmQ70IV5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SynmQ70IV5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC44.49■■■■■ 4.71
SynmQ70IV5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
SynmQ70IV5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
SynmQ70IV5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
SynmQ70IV5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
SynmQ70IV5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.38■■■■■ 4.69
SynmQ70IV5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
SynmQ70IV5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
SynmQ70IV5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
SynmQ70IV5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
SynmQ70IV5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
SynmQ70IV5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC44.14■■■■■ 4.66
SynmQ70IV5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
SynmQ70IV5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
SynmQ70IV5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
SynmQ70IV5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
SynmQ70IV5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
SynmQ70IV5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
SynmQ70IV5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
SynmQ70IV5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
SynmQ70IV5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.91■■■■■ 4.62
SynmQ70IV5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
SynmQ70IV5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
SynmQ70IV5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
SynmQ70IV5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
SynmQ70IV5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
SynmQ70IV5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
SynmQ70IV5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
SynmQ70IV5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC43.8■■■■■ 4.6
SynmQ70IV5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
SynmQ70IV5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
SynmQ70IV5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC43.77■■■■■ 4.6
SynmQ70IV5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
SynmQ70IV5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
SynmQ70IV5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
SynmQ70IV5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
SynmQ70IV5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
SynmQ70IV5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
SynmQ70IV5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
SynmQ70IV5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
SynmQ70IV5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC43.57■■■■■ 4.57
SynmQ70IV5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC43.56■■■■■ 4.56
SynmQ70IV5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
SynmQ70IV5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
SynmQ70IV5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
SynmQ70IV5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
SynmQ70IV5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
SynmQ70IV5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
SynmQ70IV5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms