Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC45.48■■■■■ 4.87
Gapvd1Q6PAR5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
Gapvd1Q6PAR5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Gapvd1Q6PAR5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.31■■■■■ 4.84
Gapvd1Q6PAR5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
Gapvd1Q6PAR5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Gapvd1Q6PAR5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Gapvd1Q6PAR5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Gapvd1Q6PAR5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
Gapvd1Q6PAR5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
Gapvd1Q6PAR5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC45.09■■■■■ 4.81
Gapvd1Q6PAR5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
Gapvd1Q6PAR5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Gapvd1Q6PAR5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Gapvd1Q6PAR5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Gapvd1Q6PAR5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
Gapvd1Q6PAR5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Gapvd1Q6PAR5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
Gapvd1Q6PAR5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
Gapvd1Q6PAR5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
Gapvd1Q6PAR5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC44.68■■■■■ 4.74
Gapvd1Q6PAR5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
Gapvd1Q6PAR5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC44.53■■■■■ 4.72
Gapvd1Q6PAR5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Gapvd1Q6PAR5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
Gapvd1Q6PAR5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
Gapvd1Q6PAR5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
Gapvd1Q6PAR5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Gapvd1Q6PAR5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
Gapvd1Q6PAR5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
Gapvd1Q6PAR5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Gapvd1Q6PAR5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Gapvd1Q6PAR5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
Gapvd1Q6PAR5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
Gapvd1Q6PAR5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Gapvd1Q6PAR5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
Gapvd1Q6PAR5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC44.19■■■■■ 4.66
Gapvd1Q6PAR5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC44.13■■■■■ 4.65
Gapvd1Q6PAR5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Gapvd1Q6PAR5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
Gapvd1Q6PAR5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Gapvd1Q6PAR5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
Gapvd1Q6PAR5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Gapvd1Q6PAR5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
Gapvd1Q6PAR5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Gapvd1Q6PAR5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Gapvd1Q6PAR5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC44■■■■■ 4.63
Gapvd1Q6PAR5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.96■■■■■ 4.63
Gapvd1Q6PAR5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Gapvd1Q6PAR5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Gapvd1Q6PAR5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Gapvd1Q6PAR5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Gapvd1Q6PAR5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC43.89■■■■■ 4.62
Gapvd1Q6PAR5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
Gapvd1Q6PAR5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
Gapvd1Q6PAR5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC43.83■■■■■ 4.61
Gapvd1Q6PAR5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
Gapvd1Q6PAR5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Gapvd1Q6PAR5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
Gapvd1Q6PAR5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Gapvd1Q6PAR5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Gapvd1Q6PAR5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
Gapvd1Q6PAR5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Gapvd1Q6PAR5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Gapvd1Q6PAR5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
Gapvd1Q6PAR5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Gapvd1Q6PAR5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Gapvd1Q6PAR5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Gapvd1Q6PAR5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Gapvd1Q6PAR5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC43.52■■■■■ 4.56
Gapvd1Q6PAR5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Gapvd1Q6PAR5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Gapvd1Q6PAR5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Gapvd1Q6PAR5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Gapvd1Q6PAR5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Gapvd1Q6PAR5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Gapvd1Q6PAR5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Gapvd1Q6PAR5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Gapvd1Q6PAR5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
Gapvd1Q6PAR5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Gapvd1Q6PAR5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC43.28■■■■■ 4.52
Gapvd1Q6PAR5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Gapvd1Q6PAR5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
Gapvd1Q6PAR5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Gapvd1Q6PAR5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Gapvd1Q6PAR5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
Gapvd1Q6PAR5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Gapvd1Q6PAR5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Gapvd1Q6PAR5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Gapvd1Q6PAR5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Gapvd1Q6PAR5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Gapvd1Q6PAR5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
Gapvd1Q6PAR5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
Gapvd1Q6PAR5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Gapvd1Q6PAR5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC43.06■■■■■ 4.48
Gapvd1Q6PAR5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms