Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF0

Ocrl, Inositol polyphosphate 5-phosphatase OCRL-1, mousemouse

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OcrlQ6NVF0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
OcrlQ6NVF0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
OcrlQ6NVF0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
OcrlQ6NVF0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
OcrlQ6NVF0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
OcrlQ6NVF0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
OcrlQ6NVF0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
OcrlQ6NVF0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
OcrlQ6NVF0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
OcrlQ6NVF0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
OcrlQ6NVF0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
OcrlQ6NVF0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
OcrlQ6NVF0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
OcrlQ6NVF0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
OcrlQ6NVF0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
OcrlQ6NVF0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
OcrlQ6NVF0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
OcrlQ6NVF0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
OcrlQ6NVF0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
OcrlQ6NVF0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
OcrlQ6NVF0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
OcrlQ6NVF0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
OcrlQ6NVF0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
OcrlQ6NVF0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
OcrlQ6NVF0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
OcrlQ6NVF0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
OcrlQ6NVF0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
OcrlQ6NVF0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
OcrlQ6NVF0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.69
OcrlQ6NVF0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
OcrlQ6NVF0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
OcrlQ6NVF0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
OcrlQ6NVF0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
OcrlQ6NVF0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
OcrlQ6NVF0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
OcrlQ6NVF0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
OcrlQ6NVF0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
OcrlQ6NVF0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
OcrlQ6NVF0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
OcrlQ6NVF0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
OcrlQ6NVF0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
OcrlQ6NVF0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
OcrlQ6NVF0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
OcrlQ6NVF0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
OcrlQ6NVF0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
OcrlQ6NVF0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
OcrlQ6NVF0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
OcrlQ6NVF0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
OcrlQ6NVF0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
OcrlQ6NVF0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
OcrlQ6NVF0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
OcrlQ6NVF0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
OcrlQ6NVF0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
OcrlQ6NVF0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
OcrlQ6NVF0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
OcrlQ6NVF0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
OcrlQ6NVF0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
OcrlQ6NVF0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
OcrlQ6NVF0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
OcrlQ6NVF0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
OcrlQ6NVF0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
OcrlQ6NVF0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
OcrlQ6NVF0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
OcrlQ6NVF0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
OcrlQ6NVF0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
OcrlQ6NVF0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
OcrlQ6NVF0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
OcrlQ6NVF0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
OcrlQ6NVF0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
OcrlQ6NVF0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
OcrlQ6NVF0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
OcrlQ6NVF0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
OcrlQ6NVF0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
OcrlQ6NVF0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
OcrlQ6NVF0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
OcrlQ6NVF0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
OcrlQ6NVF0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
OcrlQ6NVF0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
OcrlQ6NVF0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
OcrlQ6NVF0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
OcrlQ6NVF0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
OcrlQ6NVF0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
OcrlQ6NVF0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
OcrlQ6NVF0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
OcrlQ6NVF0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
OcrlQ6NVF0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
OcrlQ6NVF0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
OcrlQ6NVF0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
OcrlQ6NVF0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
OcrlQ6NVF0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
OcrlQ6NVF0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
OcrlQ6NVF0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
OcrlQ6NVF0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
OcrlQ6NVF0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
OcrlQ6NVF0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
OcrlQ6NVF0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
OcrlQ6NVF0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
OcrlQ6NVF0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
OcrlQ6NVF0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
OcrlQ6NVF0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms