Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
Smarca2Q6DIC0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
Smarca2Q6DIC0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
Smarca2Q6DIC0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
Smarca2Q6DIC0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC48.56■■■■■ 5.36
Smarca2Q6DIC0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
Smarca2Q6DIC0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
Smarca2Q6DIC0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC48.49■■■■■ 5.35
Smarca2Q6DIC0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
Smarca2Q6DIC0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
Smarca2Q6DIC0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
Smarca2Q6DIC0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.41■■■■■ 5.34
Smarca2Q6DIC0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.41■■■■■ 5.34
Smarca2Q6DIC0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.4■■■■■ 5.34
Smarca2Q6DIC0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC48.4■■■■■ 5.34
Smarca2Q6DIC0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
Smarca2Q6DIC0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC48.32■■■■■ 5.33
Smarca2Q6DIC0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC48.29■■■■■ 5.32
Smarca2Q6DIC0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
Smarca2Q6DIC0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
Smarca2Q6DIC0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
Smarca2Q6DIC0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
Smarca2Q6DIC0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC48.17■■■■■ 5.3
Smarca2Q6DIC0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC48.17■■■■■ 5.3
Smarca2Q6DIC0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
Smarca2Q6DIC0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC48.15■■■■■ 5.3
Smarca2Q6DIC0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.15■■■■■ 5.3
Smarca2Q6DIC0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
Smarca2Q6DIC0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
Smarca2Q6DIC0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
Smarca2Q6DIC0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.12■■■■■ 5.29
Smarca2Q6DIC0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC48.09■■■■■ 5.29
Smarca2Q6DIC0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
Smarca2Q6DIC0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
Smarca2Q6DIC0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
Smarca2Q6DIC0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC48.05■■■■■ 5.28
Smarca2Q6DIC0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
Smarca2Q6DIC0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
Smarca2Q6DIC0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.99■■■■■ 5.27
Smarca2Q6DIC0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
Smarca2Q6DIC0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC47.96■■■■■ 5.27
Smarca2Q6DIC0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
Smarca2Q6DIC0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC47.93■■■■■ 5.26
Smarca2Q6DIC0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
Smarca2Q6DIC0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.87■■■■■ 5.25
Smarca2Q6DIC0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
Smarca2Q6DIC0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
Smarca2Q6DIC0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
Smarca2Q6DIC0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.83■■■■■ 5.25
Smarca2Q6DIC0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
Smarca2Q6DIC0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
Smarca2Q6DIC0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
Smarca2Q6DIC0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
Smarca2Q6DIC0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
Smarca2Q6DIC0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
Smarca2Q6DIC0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
Smarca2Q6DIC0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC47.73■■■■■ 5.23
Smarca2Q6DIC0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC47.72■■■■■ 5.23
Smarca2Q6DIC0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
Smarca2Q6DIC0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC47.7■■■■■ 5.23
Smarca2Q6DIC0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
Smarca2Q6DIC0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC47.67■■■■■ 5.22
Smarca2Q6DIC0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
Smarca2Q6DIC0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
Smarca2Q6DIC0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
Smarca2Q6DIC0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC47.6■■■■■ 5.21
Smarca2Q6DIC0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
Smarca2Q6DIC0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
Smarca2Q6DIC0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC47.56■■■■■ 5.2
Smarca2Q6DIC0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
Smarca2Q6DIC0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC47.54■■■■■ 5.2
Smarca2Q6DIC0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC47.51■■■■■ 5.2
Smarca2Q6DIC0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
Smarca2Q6DIC0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
Smarca2Q6DIC0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC47.44■■■■■ 5.18
Smarca2Q6DIC0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.17
Smarca2Q6DIC0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
Smarca2Q6DIC0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
Smarca2Q6DIC0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC47.34■■■■■ 5.17
Smarca2Q6DIC0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC47.32■■■■■ 5.17
Smarca2Q6DIC0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC47.32■■■■■ 5.17
Smarca2Q6DIC0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC47.27■■■■■ 5.16
Smarca2Q6DIC0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
Smarca2Q6DIC0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC47.22■■■■■ 5.15
Smarca2Q6DIC0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC47.22■■■■■ 5.15
Smarca2Q6DIC0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC47.21■■■■■ 5.15
Smarca2Q6DIC0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
Smarca2Q6DIC0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC47.19■■■■■ 5.14
Smarca2Q6DIC0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
Smarca2Q6DIC0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.15■■■■■ 5.14
Smarca2Q6DIC0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC47.11■■■■■ 5.13
Smarca2Q6DIC0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC47.08■■■■■ 5.13
Smarca2Q6DIC0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.07■■■■■ 5.13
Smarca2Q6DIC0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
Smarca2Q6DIC0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
Smarca2Q6DIC0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
Smarca2Q6DIC0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.03■■■■■ 5.12
Smarca2Q6DIC0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
Smarca2Q6DIC0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms