Protein–RNA interactions for Protein: Q64205

Dlx3, Homeobox protein DLX-3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dlx3Q64205 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Dlx3Q64205 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Dlx3Q64205 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Dlx3Q64205 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Dlx3Q64205 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Dlx3Q64205 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Dlx3Q64205 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Dlx3Q64205 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Dlx3Q64205 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Dlx3Q64205 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Dlx3Q64205 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Dlx3Q64205 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Dlx3Q64205 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Dlx3Q64205 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Dlx3Q64205 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Dlx3Q64205 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Dlx3Q64205 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Dlx3Q64205 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Dlx3Q64205 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Dlx3Q64205 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Dlx3Q64205 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Dlx3Q64205 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Dlx3Q64205 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Dlx3Q64205 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Dlx3Q64205 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Dlx3Q64205 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Dlx3Q64205 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Dlx3Q64205 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Dlx3Q64205 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Dlx3Q64205 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dlx3Q64205 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dlx3Q64205 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Dlx3Q64205 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Dlx3Q64205 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dlx3Q64205 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Dlx3Q64205 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Dlx3Q64205 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Dlx3Q64205 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Dlx3Q64205 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Dlx3Q64205 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Dlx3Q64205 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Dlx3Q64205 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dlx3Q64205 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Dlx3Q64205 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Dlx3Q64205 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Dlx3Q64205 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dlx3Q64205 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Dlx3Q64205 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Dlx3Q64205 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Dlx3Q64205 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dlx3Q64205 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dlx3Q64205 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dlx3Q64205 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dlx3Q64205 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dlx3Q64205 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dlx3Q64205 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dlx3Q64205 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dlx3Q64205 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Dlx3Q64205 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Dlx3Q64205 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dlx3Q64205 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dlx3Q64205 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dlx3Q64205 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dlx3Q64205 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dlx3Q64205 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dlx3Q64205 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dlx3Q64205 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dlx3Q64205 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dlx3Q64205 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dlx3Q64205 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dlx3Q64205 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dlx3Q64205 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dlx3Q64205 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dlx3Q64205 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dlx3Q64205 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dlx3Q64205 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dlx3Q64205 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dlx3Q64205 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dlx3Q64205 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Dlx3Q64205 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Dlx3Q64205 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Dlx3Q64205 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dlx3Q64205 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Dlx3Q64205 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dlx3Q64205 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Dlx3Q64205 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Dlx3Q64205 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dlx3Q64205 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dlx3Q64205 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dlx3Q64205 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dlx3Q64205 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dlx3Q64205 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dlx3Q64205 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dlx3Q64205 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dlx3Q64205 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dlx3Q64205 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dlx3Q64205 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Dlx3Q64205 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dlx3Q64205 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dlx3Q64205 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms