Protein–RNA interactions for Protein: Q62293

Tgtp1, T-cell-specific guanine nucleotide triphosphate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgtp1Q62293 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Tgtp1Q62293 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Tgtp1Q62293 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Tgtp1Q62293 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tgtp1Q62293 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tgtp1Q62293 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tgtp1Q62293 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Tgtp1Q62293 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tgtp1Q62293 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Tgtp1Q62293 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tgtp1Q62293 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Tgtp1Q62293 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Tgtp1Q62293 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tgtp1Q62293 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tgtp1Q62293 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tgtp1Q62293 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Tgtp1Q62293 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tgtp1Q62293 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tgtp1Q62293 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tgtp1Q62293 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tgtp1Q62293 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tgtp1Q62293 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tgtp1Q62293 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tgtp1Q62293 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tgtp1Q62293 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tgtp1Q62293 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tgtp1Q62293 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tgtp1Q62293 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tgtp1Q62293 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tgtp1Q62293 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tgtp1Q62293 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tgtp1Q62293 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tgtp1Q62293 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tgtp1Q62293 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tgtp1Q62293 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tgtp1Q62293 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tgtp1Q62293 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tgtp1Q62293 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tgtp1Q62293 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tgtp1Q62293 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tgtp1Q62293 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tgtp1Q62293 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tgtp1Q62293 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tgtp1Q62293 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tgtp1Q62293 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tgtp1Q62293 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Tgtp1Q62293 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Tgtp1Q62293 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tgtp1Q62293 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Tgtp1Q62293 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tgtp1Q62293 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tgtp1Q62293 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tgtp1Q62293 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tgtp1Q62293 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tgtp1Q62293 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tgtp1Q62293 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tgtp1Q62293 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tgtp1Q62293 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tgtp1Q62293 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tgtp1Q62293 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tgtp1Q62293 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tgtp1Q62293 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tgtp1Q62293 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tgtp1Q62293 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tgtp1Q62293 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tgtp1Q62293 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tgtp1Q62293 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tgtp1Q62293 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tgtp1Q62293 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tgtp1Q62293 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tgtp1Q62293 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tgtp1Q62293 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tgtp1Q62293 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tgtp1Q62293 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tgtp1Q62293 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tgtp1Q62293 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tgtp1Q62293 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tgtp1Q62293 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tgtp1Q62293 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tgtp1Q62293 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tgtp1Q62293 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tgtp1Q62293 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tgtp1Q62293 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tgtp1Q62293 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tgtp1Q62293 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tgtp1Q62293 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tgtp1Q62293 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tgtp1Q62293 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tgtp1Q62293 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tgtp1Q62293 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tgtp1Q62293 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tgtp1Q62293 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tgtp1Q62293 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tgtp1Q62293 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tgtp1Q62293 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tgtp1Q62293 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tgtp1Q62293 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgtp1Q62293 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgtp1Q62293 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgtp1Q62293 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms