Protein–RNA interactions for Protein: Q504M8

Rab26, Ras-related protein Rab-26, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab26Q504M8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rab26Q504M8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rab26Q504M8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rab26Q504M8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rab26Q504M8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Rab26Q504M8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rab26Q504M8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rab26Q504M8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rab26Q504M8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rab26Q504M8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rab26Q504M8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rab26Q504M8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rab26Q504M8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rab26Q504M8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rab26Q504M8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rab26Q504M8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rab26Q504M8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rab26Q504M8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rab26Q504M8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rab26Q504M8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rab26Q504M8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rab26Q504M8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab26Q504M8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rab26Q504M8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab26Q504M8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rab26Q504M8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Rab26Q504M8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab26Q504M8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rab26Q504M8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rab26Q504M8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rab26Q504M8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rab26Q504M8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rab26Q504M8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rab26Q504M8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab26Q504M8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rab26Q504M8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rab26Q504M8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rab26Q504M8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rab26Q504M8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rab26Q504M8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rab26Q504M8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rab26Q504M8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab26Q504M8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rab26Q504M8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rab26Q504M8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab26Q504M8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab26Q504M8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rab26Q504M8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab26Q504M8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab26Q504M8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rab26Q504M8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab26Q504M8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab26Q504M8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rab26Q504M8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rab26Q504M8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rab26Q504M8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab26Q504M8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rab26Q504M8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab26Q504M8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab26Q504M8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rab26Q504M8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rab26Q504M8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rab26Q504M8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rab26Q504M8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rab26Q504M8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rab26Q504M8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rab26Q504M8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rab26Q504M8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rab26Q504M8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rab26Q504M8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rab26Q504M8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rab26Q504M8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rab26Q504M8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rab26Q504M8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Rab26Q504M8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rab26Q504M8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rab26Q504M8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rab26Q504M8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab26Q504M8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab26Q504M8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab26Q504M8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab26Q504M8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rab26Q504M8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab26Q504M8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab26Q504M8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab26Q504M8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab26Q504M8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab26Q504M8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab26Q504M8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab26Q504M8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab26Q504M8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rab26Q504M8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rab26Q504M8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab26Q504M8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rab26Q504M8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rab26Q504M8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab26Q504M8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab26Q504M8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab26Q504M8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab26Q504M8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms