Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.03■■■■■ 5.6
Ccdc136Q3TVA9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.02■■■■■ 5.6
Ccdc136Q3TVA9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50■■■■■ 5.59
Ccdc136Q3TVA9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC49.95■■■■■ 5.59
Ccdc136Q3TVA9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
Ccdc136Q3TVA9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.57
Ccdc136Q3TVA9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC49.69■■■■■ 5.55
Ccdc136Q3TVA9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
Ccdc136Q3TVA9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.54
Ccdc136Q3TVA9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.6■■■■■ 5.53
Ccdc136Q3TVA9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.56■■■■■ 5.52
Ccdc136Q3TVA9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
Ccdc136Q3TVA9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC49.52■■■■■ 5.52
Ccdc136Q3TVA9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.47■■■■■ 5.51
Ccdc136Q3TVA9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.39■■■■■ 5.5
Ccdc136Q3TVA9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC49.38■■■■■ 5.5
Ccdc136Q3TVA9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
Ccdc136Q3TVA9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.34■■■■■ 5.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC49.23■■■■■ 5.47
Ccdc136Q3TVA9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
Ccdc136Q3TVA9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC49.15■■■■■ 5.46
Ccdc136Q3TVA9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
Ccdc136Q3TVA9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
Ccdc136Q3TVA9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
Ccdc136Q3TVA9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC49.02■■■■■ 5.44
Ccdc136Q3TVA9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
Ccdc136Q3TVA9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
Ccdc136Q3TVA9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.91■■■■■ 5.42
Ccdc136Q3TVA9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC48.86■■■■■ 5.41
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
Ccdc136Q3TVA9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
Ccdc136Q3TVA9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
Ccdc136Q3TVA9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
Ccdc136Q3TVA9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.72■■■■■ 5.39
Ccdc136Q3TVA9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC48.72■■■■■ 5.39
Ccdc136Q3TVA9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
Ccdc136Q3TVA9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
Ccdc136Q3TVA9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC48.59■■■■■ 5.37
Ccdc136Q3TVA9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
Ccdc136Q3TVA9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
Ccdc136Q3TVA9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC48.5■■■■■ 5.35
Ccdc136Q3TVA9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
Ccdc136Q3TVA9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC48.48■■■■■ 5.35
Ccdc136Q3TVA9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
Ccdc136Q3TVA9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
Ccdc136Q3TVA9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC48.4■■■■■ 5.34
Ccdc136Q3TVA9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
Ccdc136Q3TVA9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
Ccdc136Q3TVA9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
Ccdc136Q3TVA9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
Ccdc136Q3TVA9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
Ccdc136Q3TVA9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
Ccdc136Q3TVA9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC48.3■■■■■ 5.32
Ccdc136Q3TVA9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
Ccdc136Q3TVA9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
Ccdc136Q3TVA9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
Ccdc136Q3TVA9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
Ccdc136Q3TVA9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
Ccdc136Q3TVA9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC48.08■■■■■ 5.29
Ccdc136Q3TVA9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC48.06■■■■■ 5.28
Ccdc136Q3TVA9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.04■■■■■ 5.28
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
Ccdc136Q3TVA9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC47.97■■■■■ 5.27
Ccdc136Q3TVA9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
Ccdc136Q3TVA9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
Ccdc136Q3TVA9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.93■■■■■ 5.26
Ccdc136Q3TVA9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
Ccdc136Q3TVA9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
Ccdc136Q3TVA9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
Ccdc136Q3TVA9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC47.74■■■■■ 5.23
Ccdc136Q3TVA9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
Ccdc136Q3TVA9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC47.62■■■■■ 5.21
Ccdc136Q3TVA9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC47.61■■■■■ 5.21
Ccdc136Q3TVA9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
Ccdc136Q3TVA9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.54■■■■■ 5.2
Ccdc136Q3TVA9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
Ccdc136Q3TVA9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC47.5■■■■■ 5.19
Ccdc136Q3TVA9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
Ccdc136Q3TVA9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.43■■■■■ 5.18
Ccdc136Q3TVA9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
Ccdc136Q3TVA9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
Ccdc136Q3TVA9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC47.4■■■■■ 5.18
Ccdc136Q3TVA9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.38■■■■■ 5.18
Ccdc136Q3TVA9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
Ccdc136Q3TVA9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
Ccdc136Q3TVA9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
Ccdc136Q3TVA9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
Ccdc136Q3TVA9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
Ccdc136Q3TVA9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
Ccdc136Q3TVA9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
Ccdc136Q3TVA9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
Ccdc136Q3TVA9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
Ccdc136Q3TVA9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC47.23■■■■■ 5.15
Ccdc136Q3TVA9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
Ccdc136Q3TVA9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
Ccdc136Q3TVA9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC47.18■■■■■ 5.14
Ccdc136Q3TVA9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
Ccdc136Q3TVA9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC47.06■■■■■ 5.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms