Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
CAMSAP2Q08AD1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC44.69■■■■■ 4.74
CAMSAP2Q08AD1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
CAMSAP2Q08AD1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
CAMSAP2Q08AD1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
CAMSAP2Q08AD1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC44.57■■■■■ 4.73
CAMSAP2Q08AD1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
CAMSAP2Q08AD1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
CAMSAP2Q08AD1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC44.56■■■■■ 4.72
CAMSAP2Q08AD1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
CAMSAP2Q08AD1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
CAMSAP2Q08AD1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
CAMSAP2Q08AD1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
CAMSAP2Q08AD1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
CAMSAP2Q08AD1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
CAMSAP2Q08AD1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
CAMSAP2Q08AD1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC44.36■■■■■ 4.69
CAMSAP2Q08AD1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
CAMSAP2Q08AD1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
CAMSAP2Q08AD1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
CAMSAP2Q08AD1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
CAMSAP2Q08AD1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
CAMSAP2Q08AD1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
CAMSAP2Q08AD1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC44.24■■■■■ 4.67
CAMSAP2Q08AD1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
CAMSAP2Q08AD1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
CAMSAP2Q08AD1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
CAMSAP2Q08AD1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
CAMSAP2Q08AD1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
CAMSAP2Q08AD1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
CAMSAP2Q08AD1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
CAMSAP2Q08AD1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
CAMSAP2Q08AD1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
CAMSAP2Q08AD1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CAMSAP2Q08AD1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
CAMSAP2Q08AD1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
CAMSAP2Q08AD1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
CAMSAP2Q08AD1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
CAMSAP2Q08AD1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC43.87■■■■■ 4.61
CAMSAP2Q08AD1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC43.86■■■■■ 4.61
CAMSAP2Q08AD1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
CAMSAP2Q08AD1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CAMSAP2Q08AD1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
CAMSAP2Q08AD1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
CAMSAP2Q08AD1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
CAMSAP2Q08AD1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
CAMSAP2Q08AD1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
CAMSAP2Q08AD1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
CAMSAP2Q08AD1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC43.74■■■■■ 4.59
CAMSAP2Q08AD1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
CAMSAP2Q08AD1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC43.7■■■■■ 4.59
CAMSAP2Q08AD1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC43.7■■■■■ 4.59
CAMSAP2Q08AD1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
CAMSAP2Q08AD1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
CAMSAP2Q08AD1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
CAMSAP2Q08AD1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC43.66■■■■■ 4.58
CAMSAP2Q08AD1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
CAMSAP2Q08AD1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
CAMSAP2Q08AD1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
CAMSAP2Q08AD1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
CAMSAP2Q08AD1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC43.6■■■■■ 4.57
CAMSAP2Q08AD1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
CAMSAP2Q08AD1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
CAMSAP2Q08AD1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
CAMSAP2Q08AD1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CAMSAP2Q08AD1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
CAMSAP2Q08AD1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
CAMSAP2Q08AD1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
CAMSAP2Q08AD1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
CAMSAP2Q08AD1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
CAMSAP2Q08AD1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CAMSAP2Q08AD1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
CAMSAP2Q08AD1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CAMSAP2Q08AD1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
CAMSAP2Q08AD1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.52
CAMSAP2Q08AD1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
CAMSAP2Q08AD1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
CAMSAP2Q08AD1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC43.25■■■■■ 4.51
CAMSAP2Q08AD1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
CAMSAP2Q08AD1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
CAMSAP2Q08AD1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
CAMSAP2Q08AD1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CAMSAP2Q08AD1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
CAMSAP2Q08AD1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
CAMSAP2Q08AD1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CAMSAP2Q08AD1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
CAMSAP2Q08AD1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CAMSAP2Q08AD1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
CAMSAP2Q08AD1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CAMSAP2Q08AD1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CAMSAP2Q08AD1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
CAMSAP2Q08AD1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
CAMSAP2Q08AD1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CAMSAP2Q08AD1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
CAMSAP2Q08AD1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
CAMSAP2Q08AD1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
CAMSAP2Q08AD1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
CAMSAP2Q08AD1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
CAMSAP2Q08AD1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
CAMSAP2Q08AD1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms