Protein–RNA interactions for Protein: Q04002

SCC2, Sister chromatid cohesion protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SCC2Q04002 FUN26YAL022C 1554 nt20.17■□□□□ 0.82
SCC2Q04002 TRM9YML014W 840 nt20.13■□□□□ 0.81
SCC2Q04002 IMP2'YIL154C 1041 nt20.1■□□□□ 0.81
SCC2Q04002 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt20.05■□□□□ 0.8
SCC2Q04002 YEL076CYEL076C 651 nt20.05■□□□□ 0.8
SCC2Q04002 YLR464WYLR464W 651 nt20.05■□□□□ 0.8
SCC2Q04002 RTG1YOL067C 534 nt20■□□□□ 0.79
SCC2Q04002 YJL152WYJL152W 360 nt19.97■□□□□ 0.79
SCC2Q04002 CCT6YDR188W 1641 nt19.97■□□□□ 0.79
SCC2Q04002 ADO1YJR105W 1023 nt19.96■□□□□ 0.79
SCC2Q04002 ERV46YAL042W 1248 nt19.92■□□□□ 0.78
SCC2Q04002 YDR433WYDR433W 441 nt19.79■□□□□ 0.76
SCC2Q04002 IDH1YNL037C 1083 nt19.79■□□□□ 0.76
SCC2Q04002 MXR2YCL033C 507 nt19.74■□□□□ 0.75
SCC2Q04002 ALF1YNL148C 765 nt19.73■□□□□ 0.75
SCC2Q04002 SIS1YNL007C 1059 nt19.69■□□□□ 0.74
SCC2Q04002 SUF2tP(AGG)C 72 nt19.68■□□□□ 0.74
SCC2Q04002 SUF10tP(AGG)N 72 nt19.68■□□□□ 0.74
SCC2Q04002 TIR4YOR009W 1464 nt19.61■□□□□ 0.73
SCC2Q04002 GBP2YCL011C 1284 nt19.54■□□□□ 0.72
SCC2Q04002 YKR040CYKR040C 504 nt19.52■□□□□ 0.72
SCC2Q04002 YPS1YLR120C 1710 nt19.49■□□□□ 0.71
SCC2Q04002 YDR094WYDR094W 336 nt19.49■□□□□ 0.71
SCC2Q04002 YDR095CYDR095C 411 nt19.48■□□□□ 0.71
SCC2Q04002 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt19.48■□□□□ 0.71
SCC2Q04002 HUA1YGR268C 597 nt19.41■□□□□ 0.7
SCC2Q04002 PTH1YHR189W 573 nt19.28■□□□□ 0.68
SCC2Q04002 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt19.22■□□□□ 0.67
SCC2Q04002 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt19.22■□□□□ 0.67
SCC2Q04002 TCD2YKL027W 1344 nt19.15■□□□□ 0.66
SCC2Q04002 ART5YGR068C 1761 nt19.13■□□□□ 0.65
SCC2Q04002 YMR057CYMR057C 372 nt19.13■□□□□ 0.65
SCC2Q04002 FRD1YEL047C 1413 nt19.12■□□□□ 0.65
SCC2Q04002 SBA1YKL117W 651 nt19.1■□□□□ 0.65
SCC2Q04002 CAC2YML102W 1407 nt19.1■□□□□ 0.65
SCC2Q04002 GFD2YCL036W 1701 nt19.03■□□□□ 0.64
SCC2Q04002 RPP2AYOL039W 321 nt19.02■□□□□ 0.63
SCC2Q04002 DED1YOR204W 1815 nt19■□□□□ 0.63
SCC2Q04002 PAU16YKL224C 372 nt18.99■□□□□ 0.63
SCC2Q04002 PTP1YDL230W 1008 nt18.93■□□□□ 0.62
SCC2Q04002 RTS2YOR077W 699 nt18.93■□□□□ 0.62
SCC2Q04002 RRD1YIL153W 1182 nt18.9■□□□□ 0.62
SCC2Q04002 YKL030WYKL030W 606 nt18.87■□□□□ 0.61
SCC2Q04002 LCB1YMR296C 1677 nt18.86■□□□□ 0.61
SCC2Q04002 PET9YBL030C 957 nt18.85■□□□□ 0.61
SCC2Q04002 PRE6YOL038W 765 nt18.83■□□□□ 0.6
SCC2Q04002 YLR235CYLR235C 399 nt18.82■□□□□ 0.6
SCC2Q04002 YCL042WYCL042W 360 nt18.81■□□□□ 0.6
SCC2Q04002 SOR2YDL246C 1074 nt18.8■□□□□ 0.6
SCC2Q04002 SOR1YJR159W 1074 nt18.8■□□□□ 0.6
SCC2Q04002 FMT1YBL013W 1206 nt18.76■□□□□ 0.59
SCC2Q04002 FPS1YLL043W 2010 nt18.73■□□□□ 0.59
SCC2Q04002 MEP2YNL142W 1500 nt18.6■□□□□ 0.57
SCC2Q04002 YFR018CYFR018C 1092 nt18.59■□□□□ 0.57
SCC2Q04002 DCW1YKL046C 1350 nt18.58■□□□□ 0.56
SCC2Q04002 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt18.53■□□□□ 0.56
SCC2Q04002 CWP1YKL096W 720 nt18.52■□□□□ 0.55
SCC2Q04002 RRT5YFR032C 870 nt18.49■□□□□ 0.55
SCC2Q04002 TIM23YNR017W 669 nt18.49■□□□□ 0.55
SCC2Q04002 DIC1YLR348C 897 nt18.45■□□□□ 0.54
SCC2Q04002 SPT5YML010W 3192 nt18.41■□□□□ 0.54
SCC2Q04002 SNF6YHL025W 999 nt18.41■□□□□ 0.54
SCC2Q04002 ADH2YMR303C 1047 nt18.41■□□□□ 0.54
SCC2Q04002 CUE1YMR264W 612 nt18.39■□□□□ 0.54
SCC2Q04002 IRC15YPL017C 1500 nt18.39■□□□□ 0.53
SCC2Q04002 YLR179CYLR179C 606 nt18.36■□□□□ 0.53
SCC2Q04002 FMP52YER004W 696 nt18.3■□□□□ 0.52
SCC2Q04002 EMI2YDR516C 1503 nt18.23■□□□□ 0.51
SCC2Q04002 YFL066CYFL066C 1179 nt18.21■□□□□ 0.51
SCC2Q04002 YPR064WYPR064W 420 nt18.19■□□□□ 0.5
SCC2Q04002 WSC2YNL283C 1512 nt18.18■□□□□ 0.5
SCC2Q04002 YDL221WYDL221W 552 nt18.15■□□□□ 0.5
SCC2Q04002 YIL100WYIL100W 354 nt18.14■□□□□ 0.5
SCC2Q04002 PEX25YPL112C 1185 nt18.14■□□□□ 0.5
SCC2Q04002 GIS3YLR094C 1509 nt18.14■□□□□ 0.49
SCC2Q04002 TAD3YLR316C 969 nt18.09■□□□□ 0.49
SCC2Q04002 NAT4YMR069W 858 nt18.08■□□□□ 0.49
SCC2Q04002 PCM1YEL058W 1674 nt18.02■□□□□ 0.47
SCC2Q04002 YIH1YCR059C 777 nt17.95■□□□□ 0.46
SCC2Q04002 GLK1YCL040W 1503 nt17.94■□□□□ 0.46
SCC2Q04002 YNL115CYNL115C 1935 nt17.94■□□□□ 0.46
SCC2Q04002 AHT1YHR093W 549 nt17.94■□□□□ 0.46
SCC2Q04002 RNQ1YCL028W 1218 nt17.91■□□□□ 0.46
SCC2Q04002 MSF1YPR047W 1410 nt17.88■□□□□ 0.45
SCC2Q04002 YSP3YOR003W 1437 nt17.86■□□□□ 0.45
SCC2Q04002 YSC84YHR016C 1407 nt17.83■□□□□ 0.44
SCC2Q04002 MIR1YJR077C 936 nt17.82■□□□□ 0.44
SCC2Q04002 BDH1YAL060W 1149 nt17.82■□□□□ 0.44
SCC2Q04002 YLL053CYLL053C 459 nt17.79■□□□□ 0.44
SCC2Q04002 YMR244WYMR244W 1068 nt17.78■□□□□ 0.44
SCC2Q04002 SCC4YER147C 1875 nt17.78■□□□□ 0.44
SCC2Q04002 THI74YDR438W 1113 nt17.75■□□□□ 0.43
SCC2Q04002 YMR090WYMR090W 684 nt17.75■□□□□ 0.43
SCC2Q04002 SDH1YKL148C 1923 nt17.73■□□□□ 0.43
SCC2Q04002 YLR415CYLR415C 339 nt17.73■□□□□ 0.43
SCC2Q04002 BIO4YNR057C 714 nt17.73■□□□□ 0.43
SCC2Q04002 FTR1YER145C 1215 nt17.7■□□□□ 0.42
SCC2Q04002 GAL1YBR020W 1587 nt17.65■□□□□ 0.42
SCC2Q04002 TRM5YHR070W 1500 nt17.64■□□□□ 0.41
SCC2Q04002 SSA4YER103W 1929 nt17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.8 ms