Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.34
Cux2P70298 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.33
Cux2P70298 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
Cux2P70298 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC48.2■■■■■ 5.31
Cux2P70298 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC48.18■■■■■ 5.3
Cux2P70298 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC48.14■■■■■ 5.3
Cux2P70298 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
Cux2P70298 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
Cux2P70298 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
Cux2P70298 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
Cux2P70298 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
Cux2P70298 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
Cux2P70298 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC47.96■■■■■ 5.27
Cux2P70298 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
Cux2P70298 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
Cux2P70298 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
Cux2P70298 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
Cux2P70298 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
Cux2P70298 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC47.79■■■■■ 5.24
Cux2P70298 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.24
Cux2P70298 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
Cux2P70298 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
Cux2P70298 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
Cux2P70298 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
Cux2P70298 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC47.65■■■■■ 5.22
Cux2P70298 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC47.62■■■■■ 5.21
Cux2P70298 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
Cux2P70298 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
Cux2P70298 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
Cux2P70298 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
Cux2P70298 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
Cux2P70298 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
Cux2P70298 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC47.41■■■■■ 5.18
Cux2P70298 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
Cux2P70298 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.32■■■■■ 5.17
Cux2P70298 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC47.32■■■■■ 5.17
Cux2P70298 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
Cux2P70298 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
Cux2P70298 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC47.14■■■■■ 5.14
Cux2P70298 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.1■■■■■ 5.13
Cux2P70298 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
Cux2P70298 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
Cux2P70298 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
Cux2P70298 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
Cux2P70298 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC46.99■■■■■ 5.11
Cux2P70298 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
Cux2P70298 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC46.96■■■■■ 5.11
Cux2P70298 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
Cux2P70298 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC46.89■■■■■ 5.1
Cux2P70298 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
Cux2P70298 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC46.83■■■■■ 5.09
Cux2P70298 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC46.82■■■■■ 5.09
Cux2P70298 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC46.79■■■■■ 5.08
Cux2P70298 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC46.77■■■■■ 5.08
Cux2P70298 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC46.76■■■■■ 5.08
Cux2P70298 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
Cux2P70298 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
Cux2P70298 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC46.73■■■■■ 5.07
Cux2P70298 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.72■■■■■ 5.07
Cux2P70298 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.69■■■■■ 5.06
Cux2P70298 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
Cux2P70298 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
Cux2P70298 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
Cux2P70298 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
Cux2P70298 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC46.59■■■■■ 5.05
Cux2P70298 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Cux2P70298 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
Cux2P70298 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
Cux2P70298 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
Cux2P70298 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.04
Cux2P70298 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
Cux2P70298 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
Cux2P70298 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
Cux2P70298 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC46.45■■■■■ 5.03
Cux2P70298 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
Cux2P70298 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC46.35■■■■■ 5.01
Cux2P70298 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC46.33■■■■■ 5.01
Cux2P70298 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
Cux2P70298 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
Cux2P70298 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
Cux2P70298 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
Cux2P70298 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC46.25■■■■■ 4.99
Cux2P70298 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
Cux2P70298 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC46.23■■■■■ 4.99
Cux2P70298 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC46.21■■■■■ 4.99
Cux2P70298 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
Cux2P70298 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
Cux2P70298 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC46.17■■■■■ 4.98
Cux2P70298 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
Cux2P70298 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
Cux2P70298 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
Cux2P70298 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
Cux2P70298 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
Cux2P70298 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
Cux2P70298 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.96
Cux2P70298 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
Cux2P70298 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
Cux2P70298 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
Cux2P70298 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
Cux2P70298 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC45.94■■■■■ 4.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms