Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATXN1P54253 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATXN1P54253 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATXN1P54253 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATXN1P54253 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATXN1P54253 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATXN1P54253 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ATXN1P54253 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATXN1P54253 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATXN1P54253 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ATXN1P54253 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATXN1P54253 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATXN1P54253 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATXN1P54253 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATXN1P54253 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATXN1P54253 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATXN1P54253 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATXN1P54253 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATXN1P54253 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATXN1P54253 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATXN1P54253 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATXN1P54253 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATXN1P54253 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ATXN1P54253 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATXN1P54253 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATXN1P54253 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATXN1P54253 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATXN1P54253 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATXN1P54253 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATXN1P54253 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATXN1P54253 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATXN1P54253 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATXN1P54253 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATXN1P54253 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATXN1P54253 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATXN1P54253 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATXN1P54253 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATXN1P54253 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATXN1P54253 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATXN1P54253 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATXN1P54253 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATXN1P54253 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ATXN1P54253 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATXN1P54253 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATXN1P54253 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATXN1P54253 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATXN1P54253 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATXN1P54253 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATXN1P54253 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATXN1P54253 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATXN1P54253 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATXN1P54253 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATXN1P54253 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATXN1P54253 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATXN1P54253 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATXN1P54253 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATXN1P54253 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATXN1P54253 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ATXN1P54253 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATXN1P54253 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATXN1P54253 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATXN1P54253 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATXN1P54253 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATXN1P54253 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATXN1P54253 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATXN1P54253 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATXN1P54253 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATXN1P54253 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATXN1P54253 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATXN1P54253 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATXN1P54253 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATXN1P54253 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATXN1P54253 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATXN1P54253 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATXN1P54253 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATXN1P54253 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATXN1P54253 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATXN1P54253 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATXN1P54253 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATXN1P54253 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms