Protein–RNA interactions for Protein: P52927

Hmga2, High mobility group protein HMGI-C, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga2P52927 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hmga2P52927 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Hmga2P52927 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Hmga2P52927 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hmga2P52927 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Hmga2P52927 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hmga2P52927 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hmga2P52927 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hmga2P52927 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hmga2P52927 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hmga2P52927 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Hmga2P52927 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hmga2P52927 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hmga2P52927 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Hmga2P52927 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hmga2P52927 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hmga2P52927 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hmga2P52927 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Hmga2P52927 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmga2P52927 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmga2P52927 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmga2P52927 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmga2P52927 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hmga2P52927 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hmga2P52927 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Hmga2P52927 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmga2P52927 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmga2P52927 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hmga2P52927 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Hmga2P52927 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hmga2P52927 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmga2P52927 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hmga2P52927 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmga2P52927 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmga2P52927 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hmga2P52927 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmga2P52927 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hmga2P52927 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmga2P52927 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hmga2P52927 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hmga2P52927 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hmga2P52927 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmga2P52927 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmga2P52927 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmga2P52927 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmga2P52927 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmga2P52927 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmga2P52927 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmga2P52927 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmga2P52927 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmga2P52927 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmga2P52927 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmga2P52927 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hmga2P52927 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hmga2P52927 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmga2P52927 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmga2P52927 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmga2P52927 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmga2P52927 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmga2P52927 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmga2P52927 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmga2P52927 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmga2P52927 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmga2P52927 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hmga2P52927 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmga2P52927 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmga2P52927 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmga2P52927 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmga2P52927 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmga2P52927 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmga2P52927 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmga2P52927 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmga2P52927 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmga2P52927 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmga2P52927 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmga2P52927 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmga2P52927 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmga2P52927 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmga2P52927 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmga2P52927 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmga2P52927 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmga2P52927 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmga2P52927 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmga2P52927 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmga2P52927 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmga2P52927 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmga2P52927 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmga2P52927 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hmga2P52927 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmga2P52927 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmga2P52927 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmga2P52927 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmga2P52927 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmga2P52927 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmga2P52927 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmga2P52927 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmga2P52927 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmga2P52927 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmga2P52927 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmga2P52927 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms