Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLK3P49761 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLK3P49761 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLK3P49761 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLK3P49761 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLK3P49761 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLK3P49761 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLK3P49761 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLK3P49761 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLK3P49761 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLK3P49761 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLK3P49761 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLK3P49761 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLK3P49761 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLK3P49761 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLK3P49761 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLK3P49761 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLK3P49761 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLK3P49761 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLK3P49761 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLK3P49761 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLK3P49761 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLK3P49761 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLK3P49761 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLK3P49761 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLK3P49761 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLK3P49761 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLK3P49761 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLK3P49761 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLK3P49761 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLK3P49761 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLK3P49761 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLK3P49761 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLK3P49761 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CLK3P49761 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLK3P49761 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLK3P49761 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLK3P49761 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLK3P49761 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLK3P49761 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLK3P49761 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLK3P49761 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLK3P49761 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLK3P49761 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLK3P49761 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLK3P49761 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLK3P49761 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLK3P49761 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLK3P49761 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLK3P49761 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLK3P49761 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLK3P49761 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLK3P49761 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLK3P49761 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLK3P49761 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLK3P49761 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK3P49761 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK3P49761 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLK3P49761 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLK3P49761 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLK3P49761 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLK3P49761 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLK3P49761 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLK3P49761 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLK3P49761 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLK3P49761 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLK3P49761 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLK3P49761 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLK3P49761 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLK3P49761 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLK3P49761 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLK3P49761 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLK3P49761 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLK3P49761 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLK3P49761 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLK3P49761 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLK3P49761 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLK3P49761 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLK3P49761 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLK3P49761 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLK3P49761 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLK3P49761 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLK3P49761 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLK3P49761 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLK3P49761 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLK3P49761 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLK3P49761 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLK3P49761 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLK3P49761 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLK3P49761 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLK3P49761 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CLK3P49761 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLK3P49761 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLK3P49761 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLK3P49761 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLK3P49761 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLK3P49761 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLK3P49761 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLK3P49761 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLK3P49761 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms