Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC45.35■■■■■ 4.85
RANGAP1P46060 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC45.35■■■■■ 4.85
RANGAP1P46060 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
RANGAP1P46060 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC45.31■■■■■ 4.84
RANGAP1P46060 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
RANGAP1P46060 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
RANGAP1P46060 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
RANGAP1P46060 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC45.27■■■■■ 4.84
RANGAP1P46060 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.27■■■■■ 4.84
RANGAP1P46060 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
RANGAP1P46060 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
RANGAP1P46060 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
RANGAP1P46060 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
RANGAP1P46060 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
RANGAP1P46060 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
RANGAP1P46060 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
RANGAP1P46060 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
RANGAP1P46060 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
RANGAP1P46060 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
RANGAP1P46060 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
RANGAP1P46060 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.1■■■■■ 4.81
RANGAP1P46060 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC45.09■■■■■ 4.81
RANGAP1P46060 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
RANGAP1P46060 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC45.05■■■■■ 4.8
RANGAP1P46060 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
RANGAP1P46060 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
RANGAP1P46060 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
RANGAP1P46060 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
RANGAP1P46060 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
RANGAP1P46060 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
RANGAP1P46060 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
RANGAP1P46060 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC44.87■■■■■ 4.77
RANGAP1P46060 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC44.86■■■■■ 4.77
RANGAP1P46060 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
RANGAP1P46060 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
RANGAP1P46060 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
RANGAP1P46060 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC44.81■■■■■ 4.76
RANGAP1P46060 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC44.79■■■■■ 4.76
RANGAP1P46060 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
RANGAP1P46060 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC44.77■■■■■ 4.76
RANGAP1P46060 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC44.76■■■■■ 4.76
RANGAP1P46060 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
RANGAP1P46060 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
RANGAP1P46060 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC44.73■■■■■ 4.75
RANGAP1P46060 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
RANGAP1P46060 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
RANGAP1P46060 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
RANGAP1P46060 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
RANGAP1P46060 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC44.67■■■■■ 4.74
RANGAP1P46060 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
RANGAP1P46060 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
RANGAP1P46060 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
RANGAP1P46060 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.73
RANGAP1P46060 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
RANGAP1P46060 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
RANGAP1P46060 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC44.6■■■■■ 4.73
RANGAP1P46060 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
RANGAP1P46060 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
RANGAP1P46060 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
RANGAP1P46060 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
RANGAP1P46060 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC44.55■■■■■ 4.72
RANGAP1P46060 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
RANGAP1P46060 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
RANGAP1P46060 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
RANGAP1P46060 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC44.53■■■■■ 4.72
RANGAP1P46060 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
RANGAP1P46060 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
RANGAP1P46060 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
RANGAP1P46060 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
RANGAP1P46060 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
RANGAP1P46060 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
RANGAP1P46060 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC44.43■■■■■ 4.7
RANGAP1P46060 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
RANGAP1P46060 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
RANGAP1P46060 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
RANGAP1P46060 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC44.38■■■■■ 4.7
RANGAP1P46060 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC44.37■■■■■ 4.69
RANGAP1P46060 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
RANGAP1P46060 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
RANGAP1P46060 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
RANGAP1P46060 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
RANGAP1P46060 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
RANGAP1P46060 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
RANGAP1P46060 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
RANGAP1P46060 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
RANGAP1P46060 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
RANGAP1P46060 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
RANGAP1P46060 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
RANGAP1P46060 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
RANGAP1P46060 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC44.27■■■■■ 4.68
RANGAP1P46060 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
RANGAP1P46060 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
RANGAP1P46060 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
RANGAP1P46060 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
RANGAP1P46060 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
RANGAP1P46060 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.21■■■■■ 4.67
RANGAP1P46060 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
RANGAP1P46060 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
RANGAP1P46060 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
RANGAP1P46060 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1610.9 ms