Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CD44P16070 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CD44P16070 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CD44P16070 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CD44P16070 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CD44P16070 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CD44P16070 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CD44P16070 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CD44P16070 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CD44P16070 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CD44P16070 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CD44P16070 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CD44P16070 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CD44P16070 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CD44P16070 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CD44P16070 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CD44P16070 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CD44P16070 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CD44P16070 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CD44P16070 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CD44P16070 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CD44P16070 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CD44P16070 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CD44P16070 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CD44P16070 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CD44P16070 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CD44P16070 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CD44P16070 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CD44P16070 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CD44P16070 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CD44P16070 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CD44P16070 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CD44P16070 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CD44P16070 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CD44P16070 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CD44P16070 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CD44P16070 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CD44P16070 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CD44P16070 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CD44P16070 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CD44P16070 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CD44P16070 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CD44P16070 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CD44P16070 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CD44P16070 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CD44P16070 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CD44P16070 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CD44P16070 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CD44P16070 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CD44P16070 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CD44P16070 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CD44P16070 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CD44P16070 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CD44P16070 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CD44P16070 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CD44P16070 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CD44P16070 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CD44P16070 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CD44P16070 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CD44P16070 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CD44P16070 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CD44P16070 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CD44P16070 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CD44P16070 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CD44P16070 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CD44P16070 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CD44P16070 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CD44P16070 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CD44P16070 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CD44P16070 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CD44P16070 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CD44P16070 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CD44P16070 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CD44P16070 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CD44P16070 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CD44P16070 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CD44P16070 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CD44P16070 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CD44P16070 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CD44P16070 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CD44P16070 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CD44P16070 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CD44P16070 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CD44P16070 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CD44P16070 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CD44P16070 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CD44P16070 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CD44P16070 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CD44P16070 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CD44P16070 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CD44P16070 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CD44P16070 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CD44P16070 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CD44P16070 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CD44P16070 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CD44P16070 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CD44P16070 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CD44P16070 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CD44P16070 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CD44P16070 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms