Protein–RNA interactions for Protein: P13985

HRES1, Putative HTLV-1-related endogenous sequence, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRES1P13985 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HRES1P13985 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HRES1P13985 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HRES1P13985 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HRES1P13985 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HRES1P13985 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HRES1P13985 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HRES1P13985 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HRES1P13985 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HRES1P13985 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HRES1P13985 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HRES1P13985 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HRES1P13985 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HRES1P13985 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HRES1P13985 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HRES1P13985 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HRES1P13985 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HRES1P13985 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HRES1P13985 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HRES1P13985 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HRES1P13985 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HRES1P13985 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HRES1P13985 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HRES1P13985 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HRES1P13985 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HRES1P13985 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HRES1P13985 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HRES1P13985 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HRES1P13985 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HRES1P13985 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HRES1P13985 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HRES1P13985 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HRES1P13985 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HRES1P13985 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HRES1P13985 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HRES1P13985 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HRES1P13985 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HRES1P13985 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HRES1P13985 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HRES1P13985 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HRES1P13985 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HRES1P13985 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HRES1P13985 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HRES1P13985 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HRES1P13985 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HRES1P13985 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HRES1P13985 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HRES1P13985 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HRES1P13985 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HRES1P13985 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HRES1P13985 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HRES1P13985 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HRES1P13985 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HRES1P13985 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HRES1P13985 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HRES1P13985 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HRES1P13985 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HRES1P13985 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HRES1P13985 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HRES1P13985 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HRES1P13985 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HRES1P13985 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HRES1P13985 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HRES1P13985 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HRES1P13985 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HRES1P13985 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HRES1P13985 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HRES1P13985 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HRES1P13985 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HRES1P13985 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HRES1P13985 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HRES1P13985 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HRES1P13985 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HRES1P13985 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HRES1P13985 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HRES1P13985 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HRES1P13985 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HRES1P13985 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HRES1P13985 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HRES1P13985 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HRES1P13985 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HRES1P13985 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HRES1P13985 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HRES1P13985 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HRES1P13985 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HRES1P13985 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HRES1P13985 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HRES1P13985 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HRES1P13985 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HRES1P13985 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HRES1P13985 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HRES1P13985 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HRES1P13985 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HRES1P13985 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HRES1P13985 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HRES1P13985 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HRES1P13985 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HRES1P13985 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HRES1P13985 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HRES1P13985 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms