Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC52.61■■■■■ 6.01
TOP2AP11388 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC52.53■■■■■ 6
TOP2AP11388 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.51■■■■■ 6
TOP2AP11388 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.45■■■■■ 5.99
TOP2AP11388 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.43■■■■■ 5.98
TOP2AP11388 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC52.4■■■■■ 5.98
TOP2AP11388 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC52.39■■■■■ 5.98
TOP2AP11388 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.38■■■■■ 5.98
TOP2AP11388 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC52.34■■■■■ 5.97
TOP2AP11388 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC52.33■■■■■ 5.97
TOP2AP11388 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC52.29■■■■■ 5.96
TOP2AP11388 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.18■■■■■ 5.94
TOP2AP11388 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC52.18■■■■■ 5.94
TOP2AP11388 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.11■■■■■ 5.93
TOP2AP11388 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC52.1■■■■■ 5.93
TOP2AP11388 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC52.1■■■■■ 5.93
TOP2AP11388 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC52.09■■■■■ 5.93
TOP2AP11388 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.08■■■■■ 5.93
TOP2AP11388 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.05■■■■■ 5.92
TOP2AP11388 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.97■■■■■ 5.91
TOP2AP11388 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.97■■■■■ 5.91
TOP2AP11388 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC51.95■■■■■ 5.91
TOP2AP11388 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC51.93■■■■■ 5.9
TOP2AP11388 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.91■■■■■ 5.9
TOP2AP11388 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC51.89■■■■■ 5.9
TOP2AP11388 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC51.87■■■■■ 5.89
TOP2AP11388 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC51.84■■■■■ 5.89
TOP2AP11388 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC51.76■■■■■ 5.88
TOP2AP11388 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC51.76■■■■■ 5.88
TOP2AP11388 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC51.73■■■■■ 5.87
TOP2AP11388 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.71■■■■■ 5.87
TOP2AP11388 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
TOP2AP11388 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC51.68■■■■■ 5.86
TOP2AP11388 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC51.59■■■■■ 5.85
TOP2AP11388 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.57■■■■■ 5.85
TOP2AP11388 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC51.56■■■■■ 5.84
TOP2AP11388 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.5■■■■■ 5.84
TOP2AP11388 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC51.5■■■■■ 5.84
TOP2AP11388 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC51.48■■■■■ 5.83
TOP2AP11388 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC51.46■■■■■ 5.83
TOP2AP11388 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
TOP2AP11388 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.41■■■■■ 5.82
TOP2AP11388 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC51.4■■■■■ 5.82
TOP2AP11388 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.37■■■■■ 5.81
TOP2AP11388 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.37■■■■■ 5.81
TOP2AP11388 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC51.36■■■■■ 5.81
TOP2AP11388 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC51.35■■■■■ 5.81
TOP2AP11388 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
TOP2AP11388 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.33■■■■■ 5.81
TOP2AP11388 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC51.32■■■■■ 5.81
TOP2AP11388 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
TOP2AP11388 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC51.28■■■■■ 5.8
TOP2AP11388 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC51.26■■■■■ 5.8
TOP2AP11388 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC51.26■■■■■ 5.8
TOP2AP11388 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC51.24■■■■■ 5.79
TOP2AP11388 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.22■■■■■ 5.79
TOP2AP11388 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.22■■■■■ 5.79
TOP2AP11388 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC51.21■■■■■ 5.79
TOP2AP11388 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC51.2■■■■■ 5.79
TOP2AP11388 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
TOP2AP11388 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.09■■■■■ 5.77
TOP2AP11388 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.05■■■■■ 5.76
TOP2AP11388 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC51.03■■■■■ 5.76
TOP2AP11388 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC51.02■■■■■ 5.76
TOP2AP11388 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
TOP2AP11388 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC50.98■■■■■ 5.75
TOP2AP11388 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
TOP2AP11388 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.96■■■■■ 5.75
TOP2AP11388 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.75
TOP2AP11388 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC50.92■■■■■ 5.74
TOP2AP11388 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC50.85■■■■■ 5.73
TOP2AP11388 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC50.83■■■■■ 5.73
TOP2AP11388 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC50.76■■■■■ 5.72
TOP2AP11388 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.71
TOP2AP11388 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.69■■■■■ 5.71
TOP2AP11388 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC50.67■■■■■ 5.7
TOP2AP11388 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
TOP2AP11388 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
TOP2AP11388 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.6■■■■■ 5.69
TOP2AP11388 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC50.59■■■■■ 5.69
TOP2AP11388 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC50.58■■■■■ 5.69
TOP2AP11388 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC50.58■■■■■ 5.69
TOP2AP11388 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.56■■■■■ 5.68
TOP2AP11388 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.56■■■■■ 5.68
TOP2AP11388 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
TOP2AP11388 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
TOP2AP11388 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
TOP2AP11388 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC50.52■■■■■ 5.68
TOP2AP11388 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC50.51■■■■■ 5.68
TOP2AP11388 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC50.51■■■■■ 5.68
TOP2AP11388 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.49■■■■■ 5.67
TOP2AP11388 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC50.46■■■■■ 5.67
TOP2AP11388 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
TOP2AP11388 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
TOP2AP11388 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
TOP2AP11388 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
TOP2AP11388 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
TOP2AP11388 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC50.39■■■■■ 5.66
TOP2AP11388 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC50.36■■■■■ 5.65
TOP2AP11388 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC50.36■■■■■ 5.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms